More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1312 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 		 517 aa  1022    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  63.21 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  59.57 
 
 		 517 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  57.79 
 
 		 509 aa  465  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  51.66 
 
 		 527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  56.34 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  56.43 
 
 		 480 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.41 
 
 		 539 aa  412  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  52.08 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  50 
 
 		 452 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.4 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  52.37 
 
 		 502 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  50.1 
 
 		 543 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  47.4 
 
 		 484 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  52.25 
 
 		 478 aa  359  7e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.89 
 
 		 465 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  49.89 
 
 		 489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  49.57 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  49.5 
 
 		 493 aa  353  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.54 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.18 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  47.91 
 
 		 515 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.95 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.56 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.79 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.74 
 
 		 455 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  48.74 
 
 		 455 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  48.69 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  49.13 
 
 		 457 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  50.76 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.25 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  50.22 
 
 		 460 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.92 
 
 		 508 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.6 
 
 		 495 aa  286  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  43.96 
 
 		 491 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.39 
 
 		 532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.33 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.03 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  30.47 
 
 		 452 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  27.1 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  30.92 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  28.6 
 
 		 462 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  31.41 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  28.26 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  32 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  32.13 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  30.69 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  29.53 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  26.57 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  31.66 
 
 		 444 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.05 
 
 		 449 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.57 
 
 		 451 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  25.92 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  32.85 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.33 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  35.19 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  30.21 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  28.85 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  36.8 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  31 
 
 		 448 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  29.31 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  37.13 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  28.88 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  30.47 
 
 		 453 aa  166  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  36.79 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  33.4 
 
 		 451 aa  163  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.96 
 
 		 449 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  27.91 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  27.87 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  27.87 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  27.87 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  27.87 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  27.87 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  27.93 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  27.87 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  26.92 
 
 		 446 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  27.25 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  28.7 
 
 		 442 aa  158  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  32.77 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  30.57 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  24.09 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  27.45 
 
 		 444 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  30.36 
 
 		 451 aa  156  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  27.66 
 
 		 444 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  26.87 
 
 		 440 aa  153  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  28.48 
 
 		 452 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  32.76 
 
 		 432 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  27.23 
 
 		 443 aa  153  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  29.46 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  27.94 
 
 		 444 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  30.06 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.56 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  27.35 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  27.05 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  31.43 
 
 		 436 aa  147  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  27.23 
 
 		 431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  29.76 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  27.68 
 
 		 444 aa  146  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1514  NusB/RsmB/TIM44  25.86 
 
 		 416 aa  146  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  26.57 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>