61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1296 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  242  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  77.19 
 
 
114 aa  184  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  67.86 
 
 
116 aa  160  8.000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  77.19 
 
 
114 aa  159  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  72.81 
 
 
114 aa  154  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  56.9 
 
 
116 aa  133  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  53.98 
 
 
169 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  56.48 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  63.33 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  57.8 
 
 
115 aa  126  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  56.36 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  54.87 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  54.87 
 
 
115 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  55.14 
 
 
114 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  53.64 
 
 
114 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  53.15 
 
 
128 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  51.82 
 
 
114 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  54.13 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  53.51 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  53.33 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  52.04 
 
 
127 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  48.21 
 
 
114 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  50.91 
 
 
114 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  52.75 
 
 
114 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  51.65 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  52.78 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  51.11 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  51.11 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  51.11 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  51.11 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  51.11 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  51.11 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  46.43 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  45.24 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  40.71 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  36.94 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  34.31 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  36.54 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  34.62 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  34.29 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  35.04 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  32.98 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  32.69 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  32.69 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  34.23 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  32.04 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  33.96 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  30.56 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  33.93 
 
 
115 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  32.26 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  34.78 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  33.02 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  35.29 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  34.41 
 
 
102 aa  47.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  32.5 
 
 
125 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>