More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1292 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.53 
 
 		 921 aa  762    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.65 
 
 		 922 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  49.24 
 
 		 994 aa  829    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.13 
 
 		 933 aa  961    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  50.31 
 
 		 947 aa  862    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.21 
 
 		 984 aa  900    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  52.06 
 
 		 935 aa  847    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.42 
 
 		 996 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 950 aa  1943    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.95 
 
 		 981 aa  1083    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.02 
 
 		 918 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.82 
 
 		 964 aa  887    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.1 
 
 		 990 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  52.64 
 
 		 906 aa  859    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  48.18 
 
 		 953 aa  838    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.92 
 
 		 919 aa  847    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  52.72 
 
 		 936 aa  904    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.26 
 
 		 951 aa  858    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  61.05 
 
 		 972 aa  1112    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.02 
 
 		 918 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.39 
 
 		 931 aa  887    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.76 
 
 		 929 aa  773    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.15 
 
 		 932 aa  711    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  54.62 
 
 		 916 aa  905    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  52.53 
 
 		 918 aa  879    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  48.38 
 
 		 940 aa  768    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  54.04 
 
 		 904 aa  928    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  47.66 
 
 		 906 aa  757    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.82 
 
 		 951 aa  842    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  53.99 
 
 		 909 aa  915    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.79 
 
 		 950 aa  883    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.8 
 
 		 918 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47 
 
 		 917 aa  724    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  59.91 
 
 		 952 aa  1015    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  52.19 
 
 		 863 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  49.6 
 
 		 877 aa  572  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  47.36 
 
 		 1026 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.44 
 
 		 815 aa  439  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  33.98 
 
 		 926 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  33.8 
 
 		 893 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 924 aa  411  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  33.23 
 
 		 924 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.05 
 
 		 927 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  29.83 
 
 		 908 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  29.41 
 
 		 908 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  32.54 
 
 		 927 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  34.33 
 
 		 924 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  32.08 
 
 		 889 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  29.67 
 
 		 908 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  30.03 
 
 		 908 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  29.99 
 
 		 1003 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  31.38 
 
 		 905 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  30.75 
 
 		 967 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  32.26 
 
 		 919 aa  373  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  30.76 
 
 		 967 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  39.21 
 
 		 890 aa  356  8.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.01 
 
 		 952 aa  344  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  38.46 
 
 		 1055 aa  338  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  28.33 
 
 		 1239 aa  328  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  29.65 
 
 		 872 aa  320  7.999999999999999e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  28.6 
 
 		 1023 aa  319  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  34.74 
 
 		 1068 aa  317  8e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  35.96 
 
 		 1185 aa  310  9e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  26.83 
 
 		 1073 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  34.86 
 
 		 933 aa  293  8e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  33.16 
 
 		 1068 aa  293  8e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.97 
 
 		 762 aa  277  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  66.2 
 
 		 961 aa  275  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 843 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.44 
 
 		 709 aa  255  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.36 
 
 		 873 aa  188  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  50.53 
 
 		 1293 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  48.78 
 
 		 1175 aa  177  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.96 
 
 		 424 aa  177  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.86 
 
 		 852 aa  173  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.86 
 
 		 852 aa  173  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.86 
 
 		 852 aa  173  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  31.8 
 
 		 853 aa  171  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  41.7 
 
 		 1209 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.82 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  30.64 
 
 		 760 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 832 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  34.19 
 
 		 998 aa  134  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.65 
 
 		 835 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.09 
 
 		 950 aa  134  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.17 
 
 		 1004 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.91 
 
 		 838 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.3 
 
 		 866 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  36.95 
 
 		 891 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  40 
 
 		 861 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.49 
 
 		 817 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.86 
 
 		 861 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.86 
 
 		 861 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.75 
 
 		 707 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.57 
 
 		 837 aa  127  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.79 
 
 		 751 aa  127  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.43 
 
 		 847 aa  127  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.21 
 
 		 827 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  40 
 
 		 830 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.58 
 
 		 848 aa  125  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>