More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1247 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00746  excinuclease ABC subunit B  57.1 
 
 		 673 aa  738    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000144798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2863  excinuclease ABC, B subunit  57.1 
 
 		 673 aa  738    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0441  excinuclease ABC subunit B  56.89 
 
 		 668 aa  777    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  58.69 
 
 		 664 aa  788    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1974  excinuclease ABC subunit B  54.53 
 
 		 671 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.238105  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  58.68 
 
 		 661 aa  770    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2201  excinuclease ABC subunit B  56.41 
 
 		 664 aa  744    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1011  excinuclease ABC subunit B  54.18 
 
 		 696 aa  718    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.771852  normal  0.613992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  59.94 
 
 		 658 aa  789    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2887  excinuclease ABC subunit B  54.64 
 
 		 673 aa  740    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  56.82 
 
 		 663 aa  781    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1512  excinuclease ABC subunit B  54.75 
 
 		 940 aa  736    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2506  excinuclease ABC subunit B  57.38 
 
 		 673 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2164  excinuclease ABC, B subunit  55.27 
 
 		 671 aa  762    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  59.82 
 
 		 658 aa  794    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  59.82 
 
 		 658 aa  794    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  59.67 
 
 		 658 aa  792    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0880  excinuclease ABC subunit B  53.19 
 
 		 696 aa  734    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0086  excinuclease ABC subunit B  54.09 
 
 		 663 aa  751    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0074  excinuclease ABC subunit B  54.23 
 
 		 663 aa  752    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1974  excinuclease ABC subunit B  55.42 
 
 		 671 aa  763    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.292507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0744  excinuclease ABC subunit B  54.17 
 
 		 703 aa  736    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2003  excinuclease ABC subunit B  54.09 
 
 		 690 aa  725    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1196  excinuclease ABC subunit B  74.39 
 
 		 701 aa  1031    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  55.72 
 
 		 678 aa  759    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1051  excinuclease ABC subunit B  53.51 
 
 		 695 aa  723    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1568  excinuclease ABC subunit B  55.46 
 
 		 675 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2495  excinuclease ABC subunit B  54.26 
 
 		 1032 aa  729    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  56.27 
 
 		 665 aa  778    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1920  excinuclease ABC subunit B  53.19 
 
 		 707 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1139  excinuclease ABC subunit B  54.06 
 
 		 687 aa  728    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0652505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1875  excinuclease ABC subunit B  54.68 
 
 		 671 aa  757    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2083  excinuclease ABC subunit B  55.09 
 
 		 727 aa  741    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  58.59 
 
 		 667 aa  790    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0077  excinuclease ABC subunit B  54.87 
 
 		 679 aa  749    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.5939  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0080  excinuclease ABC subunit B  55.6 
 
 		 702 aa  759    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.935466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3219  excinuclease ABC subunit B  57.86 
 
 		 665 aa  786    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0533109  hitchhiker  0.000839421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2096  excinuclease ABC subunit B  57 
 
 		 682 aa  767    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.587064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1754  excinuclease ABC subunit B  55.59 
 
 		 678 aa  756    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  59.82 
 
 		 658 aa  794    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1741  excinuclease ABC subunit B  54.29 
 
 		 679 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  55.62 
 
 		 666 aa  765    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1361  excinuclease ABC subunit B  54 
 
 		 695 aa  726    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1133  excinuclease ABC subunit B  54.49 
 
 		 733 aa  739    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0668171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0251  excinuclease ABC subunit B  61.47 
 
 		 663 aa  816    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2036  excinuclease ABC subunit B  53.19 
 
 		 696 aa  735    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1275  excinuclease ABC subunit B  57.42 
 
 		 699 aa  770    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1626  excinuclease ABC subunit B  75.25 
 
 		 714 aa  1053    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3602  excinuclease ABC subunit B  54.27 
 
 		 731 aa  737    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510357  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2175  excinuclease ABC subunit B  53.5 
 
 		 710 aa  725    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00395254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1753  excinuclease ABC subunit B  54.02 
 
 		 666 aa  738    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4137  excinuclease ABC subunit B  52.93 
 
 		 1053 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  53.12 
 
 		 679 aa  727    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2176  excinuclease ABC subunit B  53.06 
 
 		 706 aa  729    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00882926  normal  0.14877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1797  excinuclease ABC subunit B  55.83 
 
 		 676 aa  745    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000373442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2303  excinuclease ABC subunit B  53.88 
 
 		 660 aa  728    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1833  excinuclease ABC subunit B  55.38 
 
 		 676 aa  743    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2923  excinuclease ABC subunit B  53.02 
 
 		 1011 aa  721    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.50321  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0737  excinuclease ABC subunit B  53.88 
 
 		 662 aa  731    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1019  excinuclease ABC subunit B  52.62 
 
 		 697 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231406  normal  0.390908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1782  excinuclease ABC subunit B  54.05 
 
 		 662 aa  731    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.753339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1890  excinuclease ABC subunit B  56.78 
 
 		 676 aa  776    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.570377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0144  excinuclease ABC subunit B  55.24 
 
 		 730 aa  743    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00842263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0275  excinuclease ABC subunit B  53.65 
 
 		 728 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3001  excinuclease ABC subunit B  71.97 
 
 		 719 aa  1030    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2021  excinuclease ABC subunit B  60.09 
 
 		 625 aa  790    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  54.29 
 
 		 669 aa  733    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2132  excinuclease ABC subunit B  54.22 
 
 		 928 aa  731    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0300  excinuclease ABC subunit B  55.75 
 
 		 659 aa  755    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0295  excinuclease ABC subunit B  55.92 
 
 		 659 aa  758    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.837943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1617  excinuclease ABC subunit B  54.36 
 
 		 677 aa  734    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  56.76 
 
 		 677 aa  777    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  57.82 
 
 		 673 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  57.97 
 
 		 673 aa  766    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1088  excinuclease ABC subunit B  54.52 
 
 		 675 aa  738    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2170  excinuclease ABC subunit B  55.02 
 
 		 673 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00276805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0251  excinuclease ABC subunit B  56.62 
 
 		 665 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00546906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2160  excinuclease ABC subunit B  52.96 
 
 		 721 aa  733    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23510  excinuclease ABC subunit B  55.6 
 
 		 670 aa  752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  54.65 
 
 		 692 aa  771    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  55.44 
 
 		 673 aa  759    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  57.19 
 
 		 671 aa  797    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  52.3 
 
 		 669 aa  740    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  57.1 
 
 		 668 aa  783    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2070  excinuclease ABC subunit B  75.8 
 
 		 693 aa  1075    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2210  excinuclease ABC subunit B  53.3 
 
 		 707 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  55.09 
 
 		 691 aa  770    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0699  excinuclease ABC subunit B  54.56 
 
 		 675 aa  730    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301254  normal  0.648791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  57.53 
 
 		 673 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1106  excinuclease ABC subunit B  73.73 
 
 		 705 aa  1033    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.442429  normal  0.317752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3485  excinuclease ABC subunit B  53.99 
 
 		 701 aa  760    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1308  excinuclease ABC subunit B  55.39 
 
 		 741 aa  739    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.948841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1588  excinuclease ABC subunit B  55.24 
 
 		 741 aa  736    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.359907  normal  0.0204454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2837  excinuclease ABC subunit B  73.7 
 
 		 706 aa  1043    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1828  excinuclease ABC subunit B  56.04 
 
 		 672 aa  745    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00277406  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3047  excinuclease ABC subunit B  71.97 
 
 		 719 aa  1030    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1082  excinuclease ABC subunit B  54.3 
 
 		 670 aa  731    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00208033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3350  excinuclease ABC subunit B  72.93 
 
 		 722 aa  1023    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0910729  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1033  excinuclease ABC subunit B  55.56 
 
 		 685 aa  753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1529  excinuclease ABC subunit B  56.61 
 
 		 677 aa  772    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.521978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>