58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1136 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  477  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  30.24 
 
 
306 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  34.12 
 
 
224 aa  95.5  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0973  hypothetical protein  30.7 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0948172  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  31.56 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  25.71 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  25.71 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  29.26 
 
 
203 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  28.44 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  27.65 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  30.61 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  28.51 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  29.91 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  30.16 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  25.11 
 
 
225 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  29.46 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  29.9 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  28.28 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  27.98 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  28.28 
 
 
214 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  26.9 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  28.51 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  31.25 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  24.45 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  26.47 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  28.38 
 
 
213 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  30.39 
 
 
238 aa  52  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  27.23 
 
 
224 aa  52  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  26.87 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  25.96 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  25.25 
 
 
208 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  24.89 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  24.32 
 
 
211 aa  47  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  29.88 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5582  hypothetical protein  23.76 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  22.17 
 
 
218 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  31.69 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  28.88 
 
 
226 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  28.88 
 
 
226 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  22.89 
 
 
208 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  28.88 
 
 
226 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5196  hypothetical protein  23.27 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5526  hypothetical protein  22.77 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  26.22 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5532  hypothetical protein  22.89 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5498  hypothetical protein  22.89 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5653  hypothetical protein  22.89 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5255  hypothetical protein  22.89 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  22.28 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  23.64 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  21.89 
 
 
208 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  27.5 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>