92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1135 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 318 aa  620  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  50.49 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  53.79 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  51.36 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  46.99 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  46.13 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  43.37 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.07 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  39.27 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  39.56 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  36.75 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.41 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  38.52 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  38.3 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  40.41 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  39.7 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  39.92 
 
 		 351 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  36.9 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  39.93 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  35.05 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  40.07 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  39.07 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  37.87 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  36.67 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  33.22 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  36.84 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  36.84 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  36.84 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  34.92 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  33.23 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  39.27 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  37.41 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  35.94 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  37.04 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  34.33 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  31.76 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  34.01 
 
 		 310 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  33.7 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  27.78 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  29.89 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  27.06 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  29.21 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  29.85 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  29.85 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  29.85 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  29.85 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  29.85 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  29.85 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  29.85 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.85 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  29.85 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  30 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  29.68 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  26.67 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  30.67 
 
 		 363 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  29.19 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  29.25 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.87 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  22.78 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  28.03 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  28.77 
 
 		 363 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  27.11 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  26.26 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  26.26 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  26.11 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  31.43 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  25.46 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  27.97 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  27.5 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  29.19 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  26.55 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  26.28 
 
 		 373 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  28.95 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  30.39 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  24.86 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  29.01 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  35.19 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  26.21 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  28.39 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  29.69 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  29.23 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  29.01 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  28.64 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  31.82 
 
 		 383 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  30.53 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  29.46 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  30.28 
 
 		 391 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  27.42 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  25.58 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>