More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1033 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  70.38 
 
 
563 aa  801  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  68.93 
 
 
561 aa  792  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  64.84 
 
 
561 aa  724  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  70.09 
 
 
563 aa  796  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.3396e-12 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  62.27 
 
 
556 aa  723  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  62.21 
 
 
562 aa  704  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  78.43 
 
 
561 aa  922  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  68.51 
 
 
561 aa  733  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  64.08 
 
 
675 aa  748  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  61.43 
 
 
566 aa  704  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  60.61 
 
 
568 aa  692  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  63.72 
 
 
595 aa  725  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1789  beta-lactamase domain protein  65.95 
 
 
561 aa  751  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114581  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2242  beta-lactamase domain protein  60.22 
 
 
580 aa  681  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138314  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  67.5 
 
 
561 aa  742  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  6.03701e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  62.23 
 
 
559 aa  707  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  68.21 
 
 
561 aa  773  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  65.77 
 
 
560 aa  749  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10470  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  70.86 
 
 
564 aa  800  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797206  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  70.45 
 
 
561 aa  800  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  60.25 
 
 
561 aa  714  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  76.47 
 
 
561 aa  878  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  66.79 
 
 
561 aa  769  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
561 aa  1124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0792  metallo-beta-lactamase family hydrolase  66.11 
 
 
561 aa  721  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  65.7 
 
 
616 aa  755  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  61.85 
 
 
562 aa  703  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  65.36 
 
 
561 aa  752  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  65.02 
 
 
561 aa  734  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  61.98 
 
 
650 aa  702  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  67.77 
 
 
561 aa  744  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  78.97 
 
 
561 aa  888  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  64 
 
 
565 aa  727  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1480  beta-lactamase domain protein  73.13 
 
 
561 aa  823  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0694172  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  54.23 
 
 
558 aa  601  1e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  53.69 
 
 
558 aa  602  1e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  54.23 
 
 
558 aa  601  1e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  54.23 
 
 
558 aa  601  1e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  53.33 
 
 
558 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  54.07 
 
 
558 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  45.82 
 
 
593 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  43.45 
 
 
553 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.54754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  45.8 
 
 
558 aa  493  1e-138  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  44.89 
 
 
558 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  42.88 
 
 
554 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  43.06 
 
 
559 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  43.38 
 
 
554 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  43.27 
 
 
555 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.00194e-06  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 
558 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  45.27 
 
 
558 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  41.24 
 
 
560 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.70726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  42.88 
 
 
555 aa  478  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  42.91 
 
 
558 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.65654e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  44.64 
 
 
590 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  1.43957e-06 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  42.99 
 
 
554 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.45039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  42.01 
 
 
554 aa  475  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  41.42 
 
 
555 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  43.53 
 
 
631 aa  472  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  44.76 
 
 
533 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  42.36 
 
 
554 aa  470  1e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.29126e-07  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  42.44 
 
 
555 aa  469  1e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  43.88 
 
 
547 aa  471  1e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  42.7 
 
 
556 aa  465  1e-130  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  41.28 
 
 
618 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  44.16 
 
 
569 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  459  1e-128  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  4.19922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  459  1e-128  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  459  1e-128  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  459  1e-128  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  459  1e-128  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  459  1e-128  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29936e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  459  1e-128  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.92634e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 
553 aa  461  1e-128  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  40.51 
 
 
555 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.57483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  41.92 
 
 
556 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  41.74 
 
 
556 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  1.58477e-13 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  41.56 
 
 
556 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  40.55 
 
 
566 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.24 
 
 
555 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
560 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.51 
 
 
555 aa  452  1e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.69 
 
 
555 aa  454  1e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.51 
 
 
555 aa  452  1e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.34796e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.51 
 
 
555 aa  452  1e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 
551 aa  452  1e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  41.38 
 
 
583 aa  452  1e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  40.65 
 
 
557 aa  455  1e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  41.06 
 
 
555 aa  454  1e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  40.51 
 
 
555 aa  453  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  40.51 
 
 
555 aa  452  1e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  41.05 
 
 
555 aa  454  1e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.51 
 
 
555 aa  452  1e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  40.51 
 
 
555 aa  452  1e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  40.51 
 
 
555 aa  452  1e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  42.68 
 
 
551 aa  454  1e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  42.5 
 
 
551 aa  452  1e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  41.42 
 
 
551 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.7363e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  41.61 
 
 
561 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 
561 aa  450  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  40.33 
 
 
555 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>