170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0973 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 
216 aa  433  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  58.42 
 
 
213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  55.5 
 
 
271 aa  180  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  54.95 
 
 
211 aa  174  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.16 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  55.24 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.36 
 
 
215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  52.82 
 
 
207 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.59 
 
 
210 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  53.66 
 
 
210 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.41 
 
 
212 aa  158  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  54.69 
 
 
221 aa  158  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  41.92 
 
 
211 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.22 
 
 
209 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  55.38 
 
 
208 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.08 
 
 
214 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.21 
 
 
210 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  53.33 
 
 
218 aa  154  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  43.08 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  37.5 
 
 
208 aa  152  5e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.16 
 
 
221 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.2 
 
 
210 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  52.76 
 
 
211 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  42.79 
 
 
220 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.7 
 
 
210 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.3 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.2 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  40.2 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.2 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.2 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  40.2 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.2 
 
 
210 aa  144  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.65 
 
 
210 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.37 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  43.43 
 
 
210 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.94 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.9 
 
 
204 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  40.72 
 
 
210 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  40.82 
 
 
192 aa  136  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.81 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.92 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  47.42 
 
 
213 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.1 
 
 
211 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.9 
 
 
194 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.9 
 
 
194 aa  134  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  38.54 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  49.75 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  50 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  37.19 
 
 
216 aa  124  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  38.86 
 
 
212 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35 
 
 
204 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.11 
 
 
199 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.18 
 
 
214 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.2 
 
 
215 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.39 
 
 
212 aa  121  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.97 
 
 
215 aa  121  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.45 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.17 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.68 
 
 
216 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.56 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.06 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.98 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.15 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  40.54 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  40.54 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  35.57 
 
 
217 aa  111  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1360  Dak phosphatase  39.49 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.27 
 
 
252 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.37 
 
 
201 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  34.95 
 
 
612 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.7 
 
 
213 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.8 
 
 
210 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.57 
 
 
213 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.78 
 
 
205 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.7 
 
 
213 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  37.37 
 
 
567 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.28 
 
 
213 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.95 
 
 
212 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.65 
 
 
209 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.04 
 
 
204 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.88 
 
 
215 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  36.7 
 
 
589 aa  99.4  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  35.45 
 
 
598 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.9 
 
 
219 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  35.9 
 
 
219 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  37.23 
 
 
588 aa  98.2  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  35.38 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  37.3 
 
 
554 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  35.08 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  35.38 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  35.38 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  39.58 
 
 
567 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.2 
 
 
215 aa  91.7  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3125  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.46 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  33.5 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  33.82 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  37.7 
 
 
616 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  32.42 
 
 
583 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  34.76 
 
 
583 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>