More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0866 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  100 
 
 
489 aa  990    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  49.13 
 
 
477 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1246  Peptidase M23  42.14 
 
 
446 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.73 
 
 
462 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2398  Peptidase M23  30.59 
 
 
474 aa  186  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0487248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2663  peptidase M23B  29.87 
 
 
464 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0453096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  22.71 
 
 
441 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  26.35 
 
 
419 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20310  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.15 
 
 
446 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  51.67 
 
 
411 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  27.57 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.35 
 
 
379 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  50 
 
 
524 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  49.59 
 
 
569 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  46.46 
 
 
674 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.88 
 
 
399 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.88 
 
 
399 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  45.38 
 
 
527 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  45.67 
 
 
683 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  46.51 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  48 
 
 
376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  45.24 
 
 
346 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  45.74 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  48.74 
 
 
513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.09 
 
 
305 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  44.09 
 
 
697 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  39.57 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43.65 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  44.09 
 
 
697 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  47.5 
 
 
233 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  42.11 
 
 
699 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  49.21 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  45.45 
 
 
676 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  43.94 
 
 
490 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  46.15 
 
 
271 aa  117  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.28 
 
 
287 aa  117  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  47.06 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  46.15 
 
 
271 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  47.62 
 
 
648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  44.09 
 
 
681 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  50 
 
 
646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  46.56 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  44.27 
 
 
695 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  44.2 
 
 
651 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  46.46 
 
 
529 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  48.84 
 
 
253 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  41.67 
 
 
271 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  47.66 
 
 
276 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  46.96 
 
 
347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  43.07 
 
 
692 aa  114  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  41.86 
 
 
412 aa  114  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45.24 
 
 
238 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  43.33 
 
 
314 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  45 
 
 
431 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  50 
 
 
490 aa  113  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.5 
 
 
392 aa  113  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  46.3 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  40.91 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  44.36 
 
 
480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  40.91 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  46.73 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  40.88 
 
 
690 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.06 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  26.06 
 
 
432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  42.5 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.67 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  46.28 
 
 
665 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  43.61 
 
 
473 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  39.42 
 
 
680 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  40.91 
 
 
472 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  41.35 
 
 
621 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  43.61 
 
 
472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  43.15 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  47.06 
 
 
379 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  43.85 
 
 
414 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  38.69 
 
 
681 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  39.42 
 
 
676 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.6 
 
 
404 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  42.11 
 
 
656 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 
475 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  43.28 
 
 
651 aa  110  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  43.28 
 
 
651 aa  110  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  42.86 
 
 
473 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  28.7 
 
 
414 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  49.14 
 
 
538 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.74 
 
 
372 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  42.06 
 
 
229 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  42.86 
 
 
475 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  42.54 
 
 
415 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  47.86 
 
 
286 aa  109  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  40.43 
 
 
615 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  44.17 
 
 
464 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  42.11 
 
 
468 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  42.98 
 
 
265 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  39.42 
 
 
695 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  43.75 
 
 
640 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  44.27 
 
 
440 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  45 
 
 
454 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  44.27 
 
 
440 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  41.22 
 
 
465 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>