More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0854 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  53.81 
 
 		 190 aa  197  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  53.3 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  48.48 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  51.52 
 
 		 195 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  50.49 
 
 		 197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  50.53 
 
 		 183 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  49.02 
 
 		 197 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  48.51 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  48.51 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  48.51 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  47.55 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  45.27 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  47.83 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  45.59 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  49.71 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  47.22 
 
 		 200 aa  138  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  47.46 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  44.07 
 
 		 182 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  45.86 
 
 		 192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  43.22 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  51.22 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  43.89 
 
 		 181 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  43.68 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  46.67 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  43.16 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  42.21 
 
 		 186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  43.88 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  44.79 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  47.46 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45.83 
 
 		 164 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  43.26 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  44.71 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  43.86 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  42.13 
 
 		 183 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  40.78 
 
 		 180 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  45.3 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  44.71 
 
 		 168 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  44.32 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  39.01 
 
 		 181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  41.62 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  44.51 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.51 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.51 
 
 		 167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.87 
 
 		 167 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  39.67 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  44.04 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  39.47 
 
 		 182 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  39.62 
 
 		 147 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  39.77 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  42.07 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  41.11 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  39.62 
 
 		 147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  42.69 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  42.53 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  39.75 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.61 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  38.07 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  33.86 
 
 		 189 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  39.38 
 
 		 156 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  37.22 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  37.22 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  40 
 
 		 194 aa  111  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  42.2 
 
 		 170 aa  111  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  36.95 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  39.24 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  39.75 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  40.61 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  47.74 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  38.12 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  40 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  38.06 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  39.51 
 
 		 150 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  42.77 
 
 		 161 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  38.27 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  39.39 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  39.88 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  37.95 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.1 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  37.5 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  38.55 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  37.99 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  40.91 
 
 		 162 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  42.86 
 
 		 191 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  39.75 
 
 		 155 aa  104  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  36.05 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  39.13 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.65 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  39.77 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.41 
 
 		 170 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.41 
 
 		 170 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.65 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  39.47 
 
 		 154 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  37.18 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  36.36 
 
 		 187 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  43.05 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  38.18 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  34.88 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  41.72 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>