127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0838 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
368 aa  751    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  48.77 
 
 
343 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  48.08 
 
 
352 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  46.11 
 
 
343 aa  292  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  46.77 
 
 
331 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  46.63 
 
 
341 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  48.74 
 
 
324 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  44.31 
 
 
352 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
358 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  34.88 
 
 
340 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  33.54 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  30.79 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 
389 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
355 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
329 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
329 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.94 
 
 
822 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  29.94 
 
 
329 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.21 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  26.96 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.42 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
322 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  28.83 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
351 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  25.2 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 
752 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
336 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  22.74 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  30.23 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  31.97 
 
 
313 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0704  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
462 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439605  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.34 
 
 
1101 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  29.23 
 
 
792 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  40.74 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.43 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  25.81 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  26.75 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  23.12 
 
 
1015 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.84 
 
 
367 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  26.87 
 
 
296 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
345 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
341 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 
303 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 
398 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
734 aa  47  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  30.7 
 
 
1169 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.23 
 
 
337 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
309 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
476 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  24.57 
 
 
280 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  31.06 
 
 
785 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
270 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
924 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  27.78 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
269 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  24.41 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  24.41 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1244  glycosyltransferase  35.21 
 
 
384 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0087282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  25.16 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  24.24 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  24.24 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  24.24 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 
1032 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  23.23 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  24.24 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1432  galactosyltransferase  25.44 
 
 
569 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000251075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
264 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
280 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
298 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>