179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0837 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  100 
 
 
176 aa  361  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  57.59 
 
 
161 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  52.44 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  50.93 
 
 
335 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  45.45 
 
 
475 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
484 aa  133  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  43.23 
 
 
287 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  43.95 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 
291 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  40 
 
 
299 aa  110  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
174 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  41.67 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
167 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
170 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  39.88 
 
 
305 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 
160 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
180 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 
156 aa  99.8  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3110  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 
176 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0202445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3077  phosphohydrolase  30.71 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.848469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  26.17 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  26.17 
 
 
134 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
195 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 
252 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2158  mutT/nudix family protein  30.5 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
168 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  34.92 
 
 
129 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2839  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  29.29 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00481979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.3 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0732  hydrolase, NUDIX family  25.22 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0292  hypothetical protein  34.33 
 
 
147 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0394428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  34.25 
 
 
126 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
168 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2861  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  28.3 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.3 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3109  mutT/nudix family protein  29.29 
 
 
192 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.3 
 
 
153 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  28.3 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.3 
 
 
153 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  31.78 
 
 
570 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  28.3 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 
131 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  29.52 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 
131 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  30.48 
 
 
229 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 
131 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.11 
 
 
216 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 
131 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 
131 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3090  phosphohydrolase, MutT/Nudix family  31.15 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 
131 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  40 
 
 
213 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 
149 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2869  NUDIX domain-containing protein  31.97 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  26.28 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2799  MutT/Nudix family protein  27.86 
 
 
174 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  29.91 
 
 
150 aa  44.7  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1000  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000136038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  26.53 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 
155 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  26.53 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  29.52 
 
 
145 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  26.53 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  26.53 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 
135 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  26.53 
 
 
161 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  26.53 
 
 
161 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  31.88 
 
 
152 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
235 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3145  ADP-ribose pyrophosphatase  30.59 
 
 
251 aa  44.3  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.087939  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  31.88 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  27.73 
 
 
352 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2018  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.06 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.83 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  30 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.86 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  23.87 
 
 
289 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0502  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  40 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  27.7 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>