More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0785 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26210  extracellular solute-binding protein, family 5  67.82 
 
 		 606 aa  860    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.825095  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0785  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 600 aa  1234    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15570  extracellular solute-binding protein, family 5  50.53 
 
 		 619 aa  577  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7203  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  41.32 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120174  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4314  extracellular solute-binding protein family 5  35.83 
 
 		 606 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.986199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1116  extracellular solute-binding protein family 5  33.81 
 
 		 635 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2827  extracellular solute-binding protein  34.86 
 
 		 592 aa  283  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0981  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0957  extracellular solute-binding protein family 5  32.72 
 
 		 611 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2541  extracellular solute-binding protein family 5  32.54 
 
 		 592 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0761  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 604 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.952848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31140  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.1 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12605  lipoprotein  26.05 
 
 		 557 aa  150  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.979525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3814  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028242  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2585  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 548 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7779  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 597 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2278  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 549 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2325  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 549 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2317  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 549 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0985915  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2258  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3931  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 555 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0539387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4005  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 555 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2306  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3946  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 554 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.436412  normal  0.0739925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4433  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 550 aa  120  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.766057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2402  extracellular solute-binding protein family 5  23.16 
 
 		 566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.951994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1633  putative solute-binding dependent transport lipoprotein  24.7 
 
 		 585 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3275  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 		 570 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0712739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11306  periplasmic oligopeptide-binding lipoprotein oppA  24.24 
 
 		 591 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08460  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.81 
 
 		 579 aa  104  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 617 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1835  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 563 aa  94.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00561184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0216  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 553 aa  94.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.923383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0255  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 554 aa  91.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192685  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  23.08 
 
 		 568 aa  90.5  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7096  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.87 
 
 		 578 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5593  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 		 567 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1954  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  21.47 
 
 		 567 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4535  extracellular solute-binding protein family 5  24.46 
 
 		 567 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8314  extracellular solute-binding protein family 5  23.09 
 
 		 576 aa  80.5  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0760  extracellular solute-binding protein family 5  22.45 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.010503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 591 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 544 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  22.62 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 524 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4848  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.63 
 
 		 539 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  29.37 
 
 		 610 aa  71.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0986  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 		 683 aa  71.6  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.732347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31150  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  22.95 
 
 		 622 aa  70.5  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0917  extracellular solute-binding protein family 5  21.88 
 
 		 592 aa  70.5  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.340529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 531 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1058  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  27.95 
 
 		 653 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 533 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 521 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  22.68 
 
 		 526 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 591 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  22.13 
 
 		 534 aa  68.2  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4315  extracellular solute-binding protein family 5  22.2 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  24.43 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  26.25 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  25.57 
 
 		 550 aa  67.4  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.15 
 
 		 529 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.66 
 
 		 592 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.15 
 
 		 529 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 536 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  21.51 
 
 		 540 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2400  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.317377  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 631 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1224  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0137957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.19 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  23.84 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0536  extracellular solute-binding protein family 5  22.18 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  24.53 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  26.49 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.19 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  20 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  21.46 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  22.38 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  23.88 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  24.57 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>