More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0744 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  100 
 
 		 311 aa  614  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  58.88 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  58.67 
 
 		 346 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  55.37 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  49.33 
 
 		 317 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  48.81 
 
 		 317 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  48.81 
 
 		 317 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  49.83 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  48.66 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  49.35 
 
 		 335 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  49.68 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  44.55 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  51.07 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  43.53 
 
 		 329 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  46.96 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  42.63 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  44.82 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  43.97 
 
 		 316 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  43.65 
 
 		 332 aa  205  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  44.44 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  45.61 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  42.62 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  40.38 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  42.48 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  39.94 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  38.31 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  41.99 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  39.56 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  38.14 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.06 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  37.25 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  35.58 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  39.74 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 314 aa  149  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  37.22 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  36.22 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  35.06 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  28.66 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  45.89 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  33.66 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  33.66 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  33.55 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.22 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  33.44 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  35.16 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  27.53 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  33.66 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  32.7 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  36.19 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  34.19 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  32.7 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  31.19 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  34.11 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  32.26 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  32.58 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  28.85 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.77 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.52 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.57 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  28.34 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.79 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  27.73 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.44 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.79 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.45 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  26.48 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  33.81 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  29.81 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.89 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.27 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  26.96 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.84 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.34 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.57 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  28.95 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  28.85 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.17 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>