More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0732 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 503 aa  1050    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  54.6 
 
 		 488 aa  545  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.76 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  45.68 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  46.32 
 
 		 451 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  39.88 
 
 		 487 aa  346  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  42.38 
 
 		 477 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  46.88 
 
 		 678 aa  309  9e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  41.9 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  49.52 
 
 		 543 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  42.19 
 
 		 829 aa  303  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  44.07 
 
 		 490 aa  303  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  49.36 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  42.31 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  43.43 
 
 		 457 aa  289  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  43.47 
 
 		 756 aa  286  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  37.85 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  41.19 
 
 		 815 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  48.73 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  42.41 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.26 
 
 		 778 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  40.77 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  50.87 
 
 		 820 aa  273  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  40.9 
 
 		 371 aa  272  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  41.04 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  40.05 
 
 		 472 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  50.87 
 
 		 1001 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.96 
 
 		 628 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  41.07 
 
 		 837 aa  259  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  40.19 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  41.4 
 
 		 333 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  39.88 
 
 		 347 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  38.13 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  41.33 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  36.29 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  39.26 
 
 		 376 aa  229  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  40.95 
 
 		 370 aa  226  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  36.29 
 
 		 398 aa  217  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  38.14 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  40.91 
 
 		 317 aa  209  8e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  35.81 
 
 		 389 aa  203  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  35.38 
 
 		 328 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  36.28 
 
 		 375 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  36.45 
 
 		 321 aa  194  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  35.82 
 
 		 1041 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  38.75 
 
 		 1037 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  39.34 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  36.86 
 
 		 1019 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  36.36 
 
 		 1478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  35.08 
 
 		 689 aa  180  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  35.91 
 
 		 366 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  34.48 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  35.49 
 
 		 423 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  37.5 
 
 		 331 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  34.16 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  32.39 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  33.43 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  32.76 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  35.18 
 
 		 359 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  33.79 
 
 		 357 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 		 369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  32.85 
 
 		 1050 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  33.67 
 
 		 368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  34.01 
 
 		 321 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  32.95 
 
 		 1059 aa  163  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  32.95 
 
 		 1059 aa  163  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.77 
 
 		 697 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  34.29 
 
 		 374 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  29.97 
 
 		 486 aa  160  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  30.32 
 
 		 465 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  35.55 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  36.02 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  34.03 
 
 		 338 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  29.85 
 
 		 373 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 		 407 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  33.22 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.03 
 
 		 337 aa  154  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.31 
 
 		 1495 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  35.64 
 
 		 1020 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  30.47 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  33.76 
 
 		 619 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.51 
 
 		 770 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  32.42 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  29.44 
 
 		 388 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  30.55 
 
 		 382 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  29.67 
 
 		 387 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  34.29 
 
 		 1018 aa  143  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  29.94 
 
 		 561 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  31.69 
 
 		 912 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  28.75 
 
 		 566 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  29.53 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  31.53 
 
 		 690 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 		 1077 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  29.63 
 
 		 806 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.77 
 
 		 1146 aa  123  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  30.79 
 
 		 1331 aa  121  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 		 619 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.29 
 
 		 1780 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  30.77 
 
 		 2457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>