More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0658 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
447 aa  893    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.31 
 
 
418 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.84 
 
 
420 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.37 
 
 
422 aa  325  8.000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  42.65 
 
 
410 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.73 
 
 
421 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.92 
 
 
406 aa  276  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.82 
 
 
475 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.52 
 
 
448 aa  266  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.98 
 
 
426 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.6 
 
 
403 aa  263  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.96 
 
 
426 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.14 
 
 
410 aa  256  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.81 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.98 
 
 
419 aa  244  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.47 
 
 
394 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.67 
 
 
411 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.24 
 
 
402 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  40.24 
 
 
405 aa  237  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.13 
 
 
416 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  34.51 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.9 
 
 
407 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.81 
 
 
403 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  35.22 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.81 
 
 
426 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.24 
 
 
419 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  34.73 
 
 
470 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  33.41 
 
 
459 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  46.59 
 
 
516 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  34.57 
 
 
473 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  34.57 
 
 
473 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  34.28 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  34.07 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  34.07 
 
 
457 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  34.07 
 
 
457 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  34.07 
 
 
459 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  33.85 
 
 
457 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  34.06 
 
 
457 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  34.06 
 
 
457 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.06 
 
 
457 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  34.06 
 
 
457 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  34.06 
 
 
457 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  34.06 
 
 
457 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  34.06 
 
 
457 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  33.7 
 
 
457 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  33.84 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0711  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.83 
 
 
261 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.53 
 
 
478 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  34.45 
 
 
476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.26 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525458  normal  0.155845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.34 
 
 
493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.95 
 
 
385 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.71 
 
 
417 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.35 
 
 
507 aa  210  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.48 
 
 
458 aa  210  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.81 
 
 
329 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.81 
 
 
405 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.16 
 
 
340 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.4 
 
 
480 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1257  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.09 
 
 
344 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.26 
 
 
512 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
414 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.52 
 
 
245 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.26 
 
 
472 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  33.98 
 
 
472 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  33.98 
 
 
472 aa  207  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.78 
 
 
505 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.75 
 
 
293 aa  206  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.13 
 
 
250 aa  206  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.07 
 
 
497 aa  206  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.71 
 
 
413 aa  203  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.7 
 
 
261 aa  203  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.41 
 
 
250 aa  203  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  33.19 
 
 
462 aa  202  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  30.43 
 
 
462 aa  202  9e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1304  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.53 
 
 
341 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  33.26 
 
 
465 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.51 
 
 
502 aa  200  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.98 
 
 
480 aa  200  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.16 
 
 
489 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.33 
 
 
491 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.72 
 
 
519 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
504 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  32.9 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.86 
 
 
254 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.78 
 
 
513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.66 
 
 
271 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  33.26 
 
 
465 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.8 
 
 
502 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  32.68 
 
 
464 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  30.85 
 
 
468 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.19 
 
 
484 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
271 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  34.93 
 
 
401 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.15 
 
 
504 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.24 
 
 
472 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.28 
 
 
276 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>