55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0634 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  832    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  49.4 
 
 
418 aa  365  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  49.88 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  48.46 
 
 
438 aa  353  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  48.84 
 
 
400 aa  322  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  43.2 
 
 
414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  44.39 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  44.5 
 
 
396 aa  289  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  42.3 
 
 
422 aa  286  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  41.57 
 
 
443 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  41.29 
 
 
388 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  41.71 
 
 
388 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  43.3 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  39.66 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  40.45 
 
 
423 aa  213  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  35.05 
 
 
428 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  41.77 
 
 
428 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  38.6 
 
 
396 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  37.43 
 
 
407 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  32.92 
 
 
392 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  42.23 
 
 
411 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  38.81 
 
 
382 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  35.87 
 
 
474 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  33.71 
 
 
372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  30.89 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  29.44 
 
 
385 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  37.01 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  31.05 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  33.24 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  34.8 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  34.35 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  33.72 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  31.73 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  31.73 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  36.31 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  31.9 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  28.26 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.94 
 
 
402 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  25.67 
 
 
399 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  25.28 
 
 
420 aa  96.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  25.81 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  25.82 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  24.94 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  25.15 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.76 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  23.35 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  24.33 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  25.75 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  20.94 
 
 
393 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  21.53 
 
 
399 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  22.61 
 
 
396 aa  60.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  28.76 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  21.72 
 
 
385 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  24.06 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  23.3 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>