More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0626 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0626  YjeF-family domain protein  100 
 
 
526 aa  988    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000297999  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3074  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.63 
 
 
526 aa  260  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.582011  normal  0.45239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.81 
 
 
536 aa  256  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2910  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.65 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2602  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.81 
 
 
495 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0670  YjeF-family domain protein  44.98 
 
 
558 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0917591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  43.66 
 
 
490 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  38.76 
 
 
497 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29270  predicted sugar kinase  42.29 
 
 
576 aa  220  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.627334  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.36 
 
 
495 aa  212  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4268  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.45 
 
 
494 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07370  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  41.11 
 
 
500 aa  203  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0789751  normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.2 
 
 
487 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.43 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.6 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  40.6 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.6 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  40.26 
 
 
473 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.96 
 
 
497 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04570  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  40.23 
 
 
481 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0993142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4463  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.62 
 
 
485 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4936  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.61 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.947599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1482  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.13 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4248  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.22 
 
 
499 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380487  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6012  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.72 
 
 
511 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0524001  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.82 
 
 
471 aa  172  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  36.19 
 
 
533 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1189  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.1 
 
 
480 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1710  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.93 
 
 
483 aa  160  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0726  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.79 
 
 
480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00728237  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0523  hypothetical protein  34.33 
 
 
587 aa  154  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23170  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  35.54 
 
 
532 aa  153  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.941587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1015  carbohydrate kinase YjeF related protein  38.68 
 
 
476 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6557  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.58 
 
 
465 aa  147  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  34.5 
 
 
499 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3858  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.93 
 
 
501 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.23 
 
 
515 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.86 
 
 
533 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  32.71 
 
 
499 aa  136  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.32 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0847  YjeF domain protein  38.62 
 
 
383 aa  134  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.86 
 
 
513 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  29.57 
 
 
466 aa  133  6.999999999999999e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.79 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  28.78 
 
 
463 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.64 
 
 
532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  31.82 
 
 
519 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16730  yjeF-like protein, hydroxyethylthiazole kinase-related  34.55 
 
 
525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.51 
 
 
504 aa  127  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  27.82 
 
 
490 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.79 
 
 
510 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.2 
 
 
538 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.2 
 
 
508 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.72 
 
 
521 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.67 
 
 
520 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.73 
 
 
524 aa  123  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  30.29 
 
 
492 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.75 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.94 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.96 
 
 
518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.69 
 
 
501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.03 
 
 
516 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.64 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.64 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.39 
 
 
542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.12 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.98 
 
 
507 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.44 
 
 
499 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.69 
 
 
476 aa  117  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  30.72 
 
 
514 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.73 
 
 
519 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  28.9 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1786  YjeF-related protein-like  33.55 
 
 
468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.63 
 
 
513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.04 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.02 
 
 
500 aa  115  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  29.94 
 
 
502 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.19 
 
 
511 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.6 
 
 
498 aa  114  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.7 
 
 
500 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  29.07 
 
 
512 aa  114  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.05 
 
 
527 aa  113  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.58 
 
 
546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  29.25 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  32.12 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.97 
 
 
501 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.62 
 
 
529 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.44 
 
 
531 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  30.72 
 
 
499 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  32.16 
 
 
499 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.57 
 
 
492 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.08 
 
 
531 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  31.17 
 
 
499 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0621  hypothetical protein  34.66 
 
 
534 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0172288  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  33.7 
 
 
507 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.98 
 
 
509 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.56 
 
 
556 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1878  hypothetical protein  32.51 
 
 
535 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00309539  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  23.7 
 
 
499 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.05 
 
 
499 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>