More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0607 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  79.25 
 
 		 429 aa  692    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  75.64 
 
 		 431 aa  660    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 429 aa  856    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  71.79 
 
 		 436 aa  617  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  69.44 
 
 		 432 aa  604  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  67.52 
 
 		 438 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  64.09 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  63.86 
 
 		 436 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.59 
 
 		 434 aa  538  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  60.36 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  60.05 
 
 		 437 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 441 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  59.46 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  59.72 
 
 		 447 aa  527  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  62.07 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  58.73 
 
 		 439 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  59.45 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  60.27 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  57.99 
 
 		 437 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  56.88 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  57.34 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  59.27 
 
 		 435 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  57.34 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  57.34 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  58.35 
 
 		 436 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  57.5 
 
 		 439 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  58.94 
 
 		 435 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  57.34 
 
 		 441 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  57.05 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  57.6 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  58.2 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  58.12 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  58.2 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  57.98 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  58.33 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  56.82 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  53.78 
 
 		 434 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  56.05 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  54.42 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  55.14 
 
 		 457 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  49.54 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 		 445 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  48.05 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  48.05 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  50.23 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  48.25 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  46.56 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  46.44 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  47.22 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.19 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  45.87 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  47.13 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.25 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  46.56 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.22 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  47.02 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  46.1 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  46.67 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  46.01 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  49.89 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.95 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  46.01 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  46.56 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  48.82 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  44.94 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  47.2 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  45.2 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  47.93 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  46.36 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  45.31 
 
 		 443 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  46.03 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  46.5 
 
 		 446 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  48.23 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  46.03 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  44.7 
 
 		 421 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  46.98 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  44.8 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  45.24 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  45.14 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  46.45 
 
 		 426 aa  360  3e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  48.23 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  48.23 
 
 		 446 aa  359  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  47.31 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  46.98 
 
 		 446 aa  360  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  47.52 
 
 		 446 aa  358  9e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  47.17 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  46.67 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  45.08 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  47.17 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  46.26 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  45.37 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  45.88 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  47.88 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  48.11 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  47.64 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  46.81 
 
 		 446 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  46.26 
 
 		 446 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>