More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0602 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  86.59 
 
 		 179 aa  316  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  83.8 
 
 		 178 aa  308  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  78.21 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  76.54 
 
 		 179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  76.54 
 
 		 179 aa  280  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 178 aa  277  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 178 aa  277  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  74.3 
 
 		 179 aa  275  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  70.95 
 
 		 179 aa  268  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  72.78 
 
 		 180 aa  265  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 180 aa  265  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  68.72 
 
 		 179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  68.16 
 
 		 179 aa  265  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 180 aa  264  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  72.78 
 
 		 180 aa  264  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  70.95 
 
 		 179 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  69.27 
 
 		 179 aa  261  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  71.11 
 
 		 180 aa  261  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  67.04 
 
 		 179 aa  261  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  69.83 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  68.72 
 
 		 177 aa  256  9e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  70.95 
 
 		 178 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  69.27 
 
 		 180 aa  255  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 178 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  70 
 
 		 179 aa  253  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 178 aa  251  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  65.92 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  67.6 
 
 		 178 aa  248  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  64.25 
 
 		 178 aa  233  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  63.69 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  62.57 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  62.01 
 
 		 181 aa  218  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  58.06 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  55.31 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  58.33 
 
 		 179 aa  205  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  60.8 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  205  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  57.53 
 
 		 187 aa  202  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  56.99 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  55 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.91 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.96 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 177 aa  190  8e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  55.38 
 
 		 187 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 178 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 178 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  55.29 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  51.14 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  54.07 
 
 		 183 aa  184  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  52.25 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>