More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0495 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 335 aa  668    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  54.85 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  52.42 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  44.61 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  47.02 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  47.31 
 
 		 359 aa  281  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  45.12 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  45.02 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  46.69 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  45.64 
 
 		 346 aa  272  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  44.92 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  42.47 
 
 		 336 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  44.64 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 340 aa  255  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  45.37 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  42.94 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  41.36 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  45.21 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  42.86 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  43.81 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  41.37 
 
 		 362 aa  238  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  42.3 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  40.3 
 
 		 358 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  41.14 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  42.04 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  40.18 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  38.44 
 
 		 358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  38.89 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  37.95 
 
 		 358 aa  208  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  38.69 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  38.72 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  36.09 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 363 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  35.8 
 
 		 363 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  35.93 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  36.04 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  36.04 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  36.04 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  36.04 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  35.99 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  36.94 
 
 		 357 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  36.04 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  36.53 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  36.9 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  35.94 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.95 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  35.95 
 
 		 328 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  35.65 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.72 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  32.94 
 
 		 340 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  35.47 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  35.03 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  36.14 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  35.14 
 
 		 340 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 		 332 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.58 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 368 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  31.93 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.55 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  31.93 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  34.3 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.23 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  32.33 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  38.6 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.34 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  37.87 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  35.1 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.13 
 
 		 355 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.41 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.73 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.77 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.54 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.77 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.47 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>