More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0381 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 445 aa  889    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  37.59 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  38.5 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  42.86 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.71 
 
 		 431 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  35.45 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.83 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.49 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 		 454 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.37 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 		 439 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  30.87 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  31.32 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.51 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.4 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  30.1 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.69 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.76 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.76 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 434 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.94 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 425 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  24.43 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  22.68 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1594  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 961 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.88 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.58 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.89 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.7 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4955  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.69 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>