More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0360 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
544 aa  1071    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 
531 aa  331  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  46.54 
 
 
540 aa  329  8e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  57.49 
 
 
540 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  42.78 
 
 
533 aa  323  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  55.95 
 
 
407 aa  323  7e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 
537 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  52.94 
 
 
562 aa  318  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  55.59 
 
 
540 aa  317  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  41.68 
 
 
538 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  45.64 
 
 
518 aa  312  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  46.68 
 
 
543 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  40.43 
 
 
545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.49 
 
 
535 aa  307  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  41.46 
 
 
533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 
538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.16 
 
 
394 aa  303  8.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  42.59 
 
 
530 aa  302  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.99 
 
 
623 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.54 
 
 
542 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 
545 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.37 
 
 
538 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.47 
 
 
538 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
542 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
528 aa  267  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.69 
 
 
546 aa  266  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 
522 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  47.48 
 
 
347 aa  259  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  51.5 
 
 
583 aa  250  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 
544 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.17 
 
 
547 aa  243  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.68 
 
 
523 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.88 
 
 
904 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
858 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.76 
 
 
532 aa  230  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.73 
 
 
538 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
529 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  47.68 
 
 
535 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
535 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  46.91 
 
 
540 aa  224  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 
550 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.38 
 
 
1150 aa  223  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.84 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
536 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
545 aa  220  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
530 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 
562 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 
625 aa  206  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 
694 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 
573 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 
563 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 
563 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 
567 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
526 aa  200  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 
566 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 
715 aa  200  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 
563 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 
686 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 
702 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 
563 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
730 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.07 
 
 
689 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 
563 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.27 
 
 
566 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  49.39 
 
 
965 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.26 
 
 
741 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 
563 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 
493 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 
561 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 
688 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
554 aa  194  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
539 aa  193  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
563 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  32.22 
 
 
716 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 
561 aa  193  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 
561 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 
563 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  36.22 
 
 
565 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  34.64 
 
 
691 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
675 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
688 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 
730 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 
712 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.78 
 
 
397 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
559 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
561 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 
572 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.1 
 
 
656 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
563 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 
688 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 
731 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  43.92 
 
 
674 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 
573 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.33 
 
 
535 aa  186  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>