52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0323 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  100 
 
 
172 aa  349  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  57.83 
 
 
179 aa  194  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  57.23 
 
 
179 aa  191  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  54.82 
 
 
176 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  54.76 
 
 
172 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1262  adenylate cyclase  49.4 
 
 
172 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102777  normal  0.401901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1326  adenylate cyclase  46.39 
 
 
172 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0444909  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1389  hypothetical protein  47.59 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  46.11 
 
 
178 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  45.51 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  43.71 
 
 
177 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  43.71 
 
 
177 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  44.31 
 
 
176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  43.71 
 
 
177 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  43.71 
 
 
177 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  43.71 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  42.61 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  46.11 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2929  adenylate cyclase, putative  43.71 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3381  putative adenylate cyclase  43.71 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1614  putative adenylate cyclase  43.71 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3999  adenylate cyclase  43.71 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4073  adenylate cyclase  43.71 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2988  putative adenylate cyclase  43.71 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0204  adenylate cyclase  43.71 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  43.11 
 
 
177 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1059  adenylate cyclase  33.91 
 
 
180 aa  87  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.743648  normal  0.0414409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  40.24 
 
 
179 aa  84.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  28.24 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  42.11 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  30.43 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0006  adenylate cyclase  37.93 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.136902 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  29.38 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  39 
 
 
176 aa  47.8  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  36.59 
 
 
171 aa  47.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  27.01 
 
 
175 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  31.69 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1648  adenylate cyclase  47.37 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175687  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0805  adenylyl cyclase CyaB  32.69 
 
 
200 aa  44.3  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.763555  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  22.86 
 
 
185 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0933  putative adenylyl cyclase CyaB  30.71 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.164628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  22.41 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  21.51 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0808  putative adenylyl cyclase CyaB  32.32 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  27.66 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1595  adenylyl cyclase CyaB  24.86 
 
 
187 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0248189  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0902  putative adenylyl cyclase CyaB  28.26 
 
 
187 aa  42  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0232  adenylyl cyclase CyaB  23.27 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  26.14 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  26.14 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0317  putative adenylyl cyclase CyaB  23.33 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  0.0901791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  31.71 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>