More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0303 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
447 aa  867    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 
423 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  42.73 
 
 
442 aa  328  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 
448 aa  326  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  44.95 
 
 
442 aa  317  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 
423 aa  315  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  41.75 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  41.75 
 
 
418 aa  309  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 
430 aa  299  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 
441 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  41.75 
 
 
426 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  41.75 
 
 
426 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  41.67 
 
 
447 aa  286  7e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  42.5 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  44.71 
 
 
460 aa  257  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  40.2 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
438 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 
439 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  39.44 
 
 
446 aa  225  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  32.23 
 
 
430 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
411 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
437 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.49 
 
 
430 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  29.64 
 
 
428 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.15 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.94 
 
 
434 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.44 
 
 
417 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  22.71 
 
 
432 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  22.48 
 
 
432 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
439 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  25.62 
 
 
428 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  25.37 
 
 
428 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  26.94 
 
 
434 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  24.53 
 
 
423 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.82 
 
 
432 aa  93.6  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  26.41 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  23.68 
 
 
423 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  24.87 
 
 
443 aa  92.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
443 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  25.96 
 
 
418 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  24.46 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  24.18 
 
 
437 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  24.09 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  23.41 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.24 
 
 
443 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  22.99 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.36 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  22.69 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  25 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.88 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  23.3 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  23.8 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  22.7 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.54 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  21.92 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  23.8 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  22.46 
 
 
434 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  26.69 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  22.44 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  21.55 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  22.82 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  25.39 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  25.09 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  24.57 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  25.34 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  24.94 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  24.94 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  25.34 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  23.72 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  26.37 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  24.54 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  23.69 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  21.43 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.41 
 
 
429 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  23.69 
 
 
425 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  26.24 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  31.87 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  25.93 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  24.74 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  31.01 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0846  hypothetical protein  21.67 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000055342  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  30.11 
 
 
433 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
433 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  24 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  30.97 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  23.9 
 
 
433 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>