More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0260 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
273 aa  547  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  80.31 
 
 
285 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  84.75 
 
 
279 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3245  glycosyl transferase family 2  84.78 
 
 
277 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.164369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0375  glycosyl transferase family 2  77.78 
 
 
337 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.293513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  60.27 
 
 
226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0170  glycosyl transferase family 2  63.2 
 
 
250 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121302  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0034  family 2 glycosyl transferase  60.54 
 
 
246 aa  232  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06720  glycosyl transferase  51.74 
 
 
445 aa  221  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5268  glycosyl transferase family 2  56.39 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180624  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0116  glycosyl transferase family 2  59.11 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3054  cell wall biogenesis glycosyltransferase  55.7 
 
 
267 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
230 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
228 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  43.24 
 
 
226 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  43.36 
 
 
231 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
236 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
268 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0243  glycosyl transferase family 2  52.65 
 
 
233 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
231 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  40.26 
 
 
238 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
221 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1450  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 
232 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.226924  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1312  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
222 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
336 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
222 aa  72  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  40.52 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1959  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  28.83 
 
 
693 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  34.5 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  24.09 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  37.93 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  30.99 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
510 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
371 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
312 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
227 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
206 aa  62.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
336 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
327 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
340 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  41.76 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.77 
 
 
1099 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
213 aa  59.3  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
252 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
238 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.29 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 
241 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
226 aa  58.9  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
450 aa  58.9  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  27.92 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
324 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.66 
 
 
498 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  28.36 
 
 
531 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>