More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0241 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
551 aa  1108    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 
546 aa  312  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  38.42 
 
 
511 aa  300  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  35.91 
 
 
560 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  34.57 
 
 
535 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  31.4 
 
 
537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  33.46 
 
 
551 aa  231  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  31.5 
 
 
537 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  32.94 
 
 
546 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  31.02 
 
 
541 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
546 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 
546 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.74 
 
 
550 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  31.36 
 
 
542 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 
554 aa  186  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 
532 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.66 
 
 
543 aa  178  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4820  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 
556 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
535 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
587 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05550  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.1 
 
 
550 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.163393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  28.83 
 
 
553 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.53 
 
 
542 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  29.19 
 
 
558 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 
534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
564 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.8 
 
 
521 aa  163  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.8 
 
 
521 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.8 
 
 
521 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.8 
 
 
521 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
521 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.89 
 
 
535 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.23 
 
 
539 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
541 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4050  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 
548 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 
562 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
557 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  30.19 
 
 
542 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 
543 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.4 
 
 
562 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  25.27 
 
 
530 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.58 
 
 
510 aa  156  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  27.07 
 
 
547 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
607 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 
545 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 
560 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.59 
 
 
505 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0020  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  27.47 
 
 
539 aa  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00232018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  29.52 
 
 
533 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.95 
 
 
524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 
544 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  25.86 
 
 
545 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  28.66 
 
 
531 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
512 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
505 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
512 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
512 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.74 
 
 
531 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
557 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  24.37 
 
 
554 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.82 
 
 
525 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.19 
 
 
532 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 
547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 
519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.52 
 
 
565 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
522 aa  140  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7613  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  27.52 
 
 
526 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1032  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.98 
 
 
544 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000591223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  29.84 
 
 
534 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
528 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.99 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
531 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  26.94 
 
 
526 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.94 
 
 
526 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3973  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 
549 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  29.82 
 
 
524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.68 
 
 
516 aa  134  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 
529 aa  134  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
510 aa  134  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0351  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  25.15 
 
 
532 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.54 
 
 
509 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
515 aa  133  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.13 
 
 
495 aa  133  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01730  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.83 
 
 
560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 
515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.24 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 
528 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
531 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
544 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2494  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  24.73 
 
 
532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2543  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  24.73 
 
 
532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0657942  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
601 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
531 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.28 
 
 
534 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.36 
 
 
524 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>