72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0202 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  35.32 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  34.76 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0384  hypothetical protein  35.34 
 
 
280 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  32.31 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0322  hypothetical protein  33.19 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0634  putative integral membrane protein  33.48 
 
 
269 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4000  protein of unknown function DUF540  30.49 
 
 
279 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.105937  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3323  protein of unknown function DUF540  32.92 
 
 
267 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  28.77 
 
 
249 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  33.2 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0194  protein of unknown function DUF540  28.74 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  29.94 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  30.32 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  25.73 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  28.31 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  26.75 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  26.75 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  26.75 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  25.84 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  26.4 
 
 
253 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  25.84 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  25.84 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  25.84 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  25.84 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  27.65 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  25.84 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  25.84 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  25.84 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  25.84 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  24.29 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  24.51 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  22.13 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  26.4 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  26.4 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  26.4 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  26.4 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  26.4 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  28.21 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  28.1 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  28 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  25.95 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  25.82 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  21.47 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  22.37 
 
 
257 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  20.08 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  22.22 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  29.03 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  25.73 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  28.39 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  24.72 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  28.39 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  28.39 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  36.23 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  29.03 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  23.35 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  29.11 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  26.45 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  27.85 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  23.6 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  24.47 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  27.85 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  27.85 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  27.85 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  24.69 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0890  hypothetical protein  23.46 
 
 
285 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  22.35 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  27.85 
 
 
259 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  27.85 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  27.85 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2099  protein of unknown function DUF540  20.5 
 
 
269 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000514107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>