More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0127 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  46.95 
 
 		 753 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 775 aa  1556    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  46.79 
 
 		 754 aa  621  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  46.98 
 
 		 764 aa  608  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  44.62 
 
 		 758 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  40.44 
 
 		 752 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.71 
 
 		 734 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.19 
 
 		 726 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  57.14 
 
 		 543 aa  335  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  56.95 
 
 		 557 aa  319  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  57.58 
 
 		 300 aa  317  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  57.76 
 
 		 299 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.83 
 
 		 299 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.85 
 
 		 507 aa  297  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  51.32 
 
 		 298 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  51.16 
 
 		 308 aa  282  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.54 
 
 		 456 aa  270  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  50.33 
 
 		 531 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  44.22 
 
 		 519 aa  235  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  36.79 
 
 		 446 aa  206  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  42.65 
 
 		 293 aa  201  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 459 aa  187  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  31.81 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  29.24 
 
 		 479 aa  183  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 		 479 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  31.57 
 
 		 479 aa  181  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.29 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.56 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  27.38 
 
 		 448 aa  170  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.02 
 
 		 472 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  38.51 
 
 		 306 aa  170  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 479 aa  169  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 		 458 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  33.56 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.54 
 
 		 461 aa  167  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 		 468 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 		 462 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 		 499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  32.17 
 
 		 461 aa  162  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  28.85 
 
 		 473 aa  161  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  27 
 
 		 461 aa  160  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.19 
 
 		 448 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.92 
 
 		 461 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.42 
 
 		 477 aa  159  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.31 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  29.16 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  30.18 
 
 		 596 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 		 461 aa  150  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.03 
 
 		 464 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.67 
 
 		 301 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  29.6 
 
 		 470 aa  148  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.88 
 
 		 473 aa  148  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  32.39 
 
 		 476 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  27.88 
 
 		 478 aa  147  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  25.81 
 
 		 462 aa  146  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 472 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  30.85 
 
 		 460 aa  144  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3153  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.14 
 
 		 303 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0290174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 458 aa  142  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 		 465 aa  141  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 		 465 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.05 
 
 		 460 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.89 
 
 		 477 aa  138  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  27.15 
 
 		 462 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.15 
 
 		 462 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 474 aa  137  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  27.54 
 
 		 602 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6599  hypothetical protein  32.57 
 
 		 316 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  29.27 
 
 		 465 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  29.75 
 
 		 456 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.62 
 
 		 478 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  28.98 
 
 		 465 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.11 
 
 		 462 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  30.9 
 
 		 466 aa  131  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.51 
 
 		 462 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.98 
 
 		 481 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 		 459 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  29.57 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  32.36 
 
 		 450 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.46 
 
 		 444 aa  126  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 		 492 aa  125  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.82 
 
 		 490 aa  125  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 467 aa  125  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.32 
 
 		 466 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 		 456 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  30.86 
 
 		 480 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8878  hypothetical protein  29.33 
 
 		 303 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  25.54 
 
 		 473 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  27.78 
 
 		 501 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  28.7 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  29.86 
 
 		 449 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  25.48 
 
 		 462 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.33 
 
 		 449 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.22 
 
 		 469 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  25.84 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  28.57 
 
 		 461 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  30.3 
 
 		 532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.23 
 
 		 444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>