More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0100 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 348 aa  694    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  67.92 
 
 		 352 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  60.06 
 
 		 345 aa  371  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  47.94 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  45.54 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  45.77 
 
 		 346 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  46.33 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  43.28 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  44.98 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  46.2 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  42.55 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  43.94 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  42.11 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  42.46 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  41.95 
 
 		 346 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  38.63 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  39.43 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  41.79 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  40.23 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  40.3 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 339 aa  209  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  38.48 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  41.49 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  40 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  37.94 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  39.53 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  37.72 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  34.66 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 353 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  36.17 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.37 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.12 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  33.14 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  38.83 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  36.15 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  37.71 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  37.27 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  34.76 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.93 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  35.57 
 
 		 360 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  34.64 
 
 		 355 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.64 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  35.86 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  35.57 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  35.57 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  35.57 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  35.57 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  35.57 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0817  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.533751  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  35.57 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  35.57 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.03 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 386 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  34.45 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.33 
 
 		 342 aa  162  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.93 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  35.19 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  36.18 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.52 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  37.68 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 336 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 355 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.74 
 
 		 339 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  33.73 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.85 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.93 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 334 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  30.37 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.18 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  30.67 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  30.67 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>