More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0098 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  100 
 
 		 278 aa  549  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  50.88 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  51.77 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  49.29 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  51.06 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  47.5 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  48.57 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  44.48 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  44.85 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  43.12 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  47.64 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  43.48 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  40.93 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  41.45 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  41.43 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  44.57 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  42.75 
 
 		 297 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  40.94 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  43.37 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  45.42 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  39.64 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  39.42 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  42.5 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  42.5 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  41.48 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  42.14 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  42.05 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  42.14 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  40.21 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  41.01 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  41.79 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  41.52 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  41.79 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  41.79 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  41.7 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  41.43 
 
 		 286 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  45.09 
 
 		 284 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  41.79 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  40.36 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  39.07 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  41.01 
 
 		 282 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  43.48 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2976  NmrA family protein  39.29 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  40.57 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03749  oxidoreductase  41.88 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  39.5 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4158  NmrA family protein  44.93 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.137704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  41.58 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  39.71 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  39.43 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  39.43 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  39.07 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  39.43 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  39.43 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  38.85 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  43.12 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  38.99 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  40.79 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  43.07 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  38.49 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  38.6 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  40 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  38.27 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  42.34 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  42.34 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  35.34 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  38.16 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  34.04 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  37.87 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2618  NmrA-like protein  40.22 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  37.59 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  30.42 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  33.1 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  29.47 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  33.1 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  32.5 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0617  NmrA family protein  40.22 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  33.45 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  37.68 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  32.09 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0277  NmrA-like  35.71 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  35.46 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  33.81 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.85 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  29.72 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  31.69 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  31.8 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  32.16 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.74 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  31.41 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.03 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.56 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2475  hypothetical protein  31.03 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0316399  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  29.96 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  29.96 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  31.69 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  27.86 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>