More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0097 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  48.52 
 
 
752 aa  719    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0595  daunorubicin resistance protein DrrC, putative  43.08 
 
 
752 aa  674    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0588759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0727  ABC transporter related protein  48.91 
 
 
752 aa  674    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4179  ABC transporter related  71.45 
 
 
795 aa  1132    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0706824  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  71.78 
 
 
805 aa  1167    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  69.81 
 
 
796 aa  1144    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  50.19 
 
 
750 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7895  excinuclease ABC subunit A  71.28 
 
 
768 aa  1128    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2061  ABC transporter related protein  60.61 
 
 
756 aa  937    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2219  ABC transporter related protein  71.34 
 
 
788 aa  1137    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1706  ABC transporter related protein  71.7 
 
 
795 aa  1136    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  74.14 
 
 
792 aa  1209    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  51.54 
 
 
790 aa  738    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  100 
 
 
792 aa  1617    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2621  ABC transporter related  72.45 
 
 
826 aa  1135    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.12429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  70.63 
 
 
797 aa  1142    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  69.92 
 
 
799 aa  1126    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0057  ABC transporter related  72.4 
 
 
797 aa  1156    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0413721  normal  0.79813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  73.38 
 
 
790 aa  1207    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2335  ABC transporter related  69.18 
 
 
797 aa  1132    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0125219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1738  ABC transporter related  70.19 
 
 
793 aa  1125    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  48.46 
 
 
753 aa  773    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  46.46 
 
 
745 aa  733    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1286  ABC transporter related protein  70.64 
 
 
827 aa  1131    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19653  hitchhiker  0.00243826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5797  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
780 aa  756    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0852128  normal  0.68212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1600  ABC transporter related protein  70.32 
 
 
798 aa  1118    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.239381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  71.7 
 
 
810 aa  1184    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  66.8 
 
 
754 aa  1046    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3201  ABC transporter related protein  72.75 
 
 
790 aa  1157    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0977104  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1999  ABC transporter related  46.15 
 
 
761 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  51.21 
 
 
758 aa  761    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  71.88 
 
 
794 aa  1191    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0889  excinuclease ATPase subunit  43.57 
 
 
760 aa  660    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.470006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  49.36 
 
 
751 aa  779    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  71.16 
 
 
794 aa  1166    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3170  ABC transporter related  70.9 
 
 
801 aa  1126    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102444 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  69.36 
 
 
795 aa  1132    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1785  ABC transporter related  70.19 
 
 
793 aa  1125    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.806156  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  69.54 
 
 
792 aa  1116    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  67.34 
 
 
798 aa  1097    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18400  Excinuclease ATPase subunit  70.45 
 
 
795 aa  1147    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  46.15 
 
 
761 aa  672    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2899  ABC transporter related  70.73 
 
 
796 aa  1142    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000977115  hitchhiker  0.0000331786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  72.24 
 
 
790 aa  1181    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1717  ABC transporter related  70.19 
 
 
793 aa  1124    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  48.44 
 
 
745 aa  753    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1760  ABC transporter related protein  67.3 
 
 
799 aa  1068    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144756  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  57.12 
 
 
798 aa  899    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3513  ABC transporter related protein  41.15 
 
 
752 aa  626  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0485409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3040  ABC transporter related  42.67 
 
 
754 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0885  excinuclease ATPase subunit  40.76 
 
 
750 aa  589  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.987216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1560  putative excision nuclease ABC subunit  65.78 
 
 
402 aa  528  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.228081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  35.48 
 
 
820 aa  482  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  36.02 
 
 
823 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  36.44 
 
 
843 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  36.74 
 
 
844 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.96 
 
 
877 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  37.33 
 
 
848 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  37.33 
 
 
848 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  37.33 
 
 
848 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  35.1 
 
 
850 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  37.63 
 
 
827 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  35.28 
 
 
838 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  35.12 
 
 
838 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  37.34 
 
 
832 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  35.56 
 
 
834 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  39.22 
 
 
947 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  35.08 
 
 
853 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  36.49 
 
 
822 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  39.4 
 
 
776 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  36.59 
 
 
860 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  34.85 
 
 
950 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  37.64 
 
 
863 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  36.88 
 
 
843 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  41.28 
 
 
963 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  35.09 
 
 
838 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  38.65 
 
 
927 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  39.28 
 
 
942 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  39.06 
 
 
945 aa  442  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  38.7 
 
 
833 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  40.93 
 
 
946 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  34.73 
 
 
861 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  40.15 
 
 
946 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1949  excinuclease ABC, A subunit  41.9 
 
 
957 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0876147  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  35.64 
 
 
894 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0314  excinuclease ABC, A subunit  36.85 
 
 
988 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  35.98 
 
 
2017 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  38.1 
 
 
942 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  35.28 
 
 
944 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1104  excinuclease ABC subunit A  38.03 
 
 
939 aa  427  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  39.5 
 
 
968 aa  428  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  34.82 
 
 
838 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  34.45 
 
 
898 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  39.68 
 
 
1019 aa  429  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  40.32 
 
 
982 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2732  excinuclease ABC, A subunit  40.99 
 
 
962 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.102392  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  35.03 
 
 
885 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  36.21 
 
 
851 aa  426  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  35.38 
 
 
881 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0677  excinuclease ABC, A subunit  39.79 
 
 
956 aa  425  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0725474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>