More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0090 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  100 
 
 		 574 aa  1140    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.12 
 
 		 558 aa  339  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.12 
 
 		 811 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.87 
 
 		 605 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  31.65 
 
 		 531 aa  233  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 482 aa  223  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.21 
 
 		 541 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  31.14 
 
 		 568 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  31.58 
 
 		 512 aa  218  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  37.5 
 
 		 517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  31.62 
 
 		 557 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  32.99 
 
 		 537 aa  213  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  28.43 
 
 		 593 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.86 
 
 		 495 aa  210  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.74 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 550 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  34.54 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  28.98 
 
 		 483 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  34.54 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  34.52 
 
 		 539 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.09 
 
 		 568 aa  203  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.12 
 
 		 510 aa  203  7e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29.25 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  34.5 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.47 
 
 		 558 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  35.54 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  35.52 
 
 		 492 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  30.31 
 
 		 528 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.1 
 
 		 490 aa  200  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  26.19 
 
 		 630 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.5 
 
 		 566 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.78 
 
 		 471 aa  198  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.55 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  28.07 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.91 
 
 		 593 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 484 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.95 
 
 		 543 aa  193  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  25.69 
 
 		 568 aa  193  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.69 
 
 		 568 aa  193  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.9 
 
 		 481 aa  193  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.12 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.44 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.9 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.08 
 
 		 568 aa  190  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.53 
 
 		 627 aa  190  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  35.71 
 
 		 490 aa  190  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  27.08 
 
 		 566 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30 
 
 		 479 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.69 
 
 		 566 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  33.53 
 
 		 512 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.1 
 
 		 553 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  26.5 
 
 		 566 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.33 
 
 		 502 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  31.68 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  27.31 
 
 		 558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.31 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  27.61 
 
 		 574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  29.65 
 
 		 582 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  29.41 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  26.31 
 
 		 566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.9 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  33.06 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  30.81 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  30.27 
 
 		 571 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  32.93 
 
 		 495 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 		 491 aa  181  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  27.51 
 
 		 548 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  28.35 
 
 		 587 aa  180  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  31.12 
 
 		 547 aa  180  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.97 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.5 
 
 		 590 aa  178  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  28.26 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  24.64 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  30.42 
 
 		 568 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.61 
 
 		 562 aa  176  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.23 
 
 		 573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.61 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.87 
 
 		 810 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.32 
 
 		 564 aa  173  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  31.16 
 
 		 895 aa  172  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  26.89 
 
 		 569 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  30.02 
 
 		 574 aa  171  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  32.7 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  32.08 
 
 		 526 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  25.15 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  28.78 
 
 		 585 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  26.65 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  26.65 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  28.43 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  34.06 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  26.91 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  26.95 
 
 		 581 aa  164  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  27.06 
 
 		 576 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  24.91 
 
 		 570 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  24.91 
 
 		 570 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.49 
 
 		 500 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>