237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0087 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
230 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  70.37 
 
 
223 aa  314  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  69.19 
 
 
225 aa  309  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  70.37 
 
 
226 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  67.28 
 
 
225 aa  300  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  64.22 
 
 
238 aa  298  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  67.43 
 
 
224 aa  297  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  65.14 
 
 
225 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  65.79 
 
 
227 aa  296  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  65.2 
 
 
225 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  65.04 
 
 
227 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  65.04 
 
 
227 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  65.04 
 
 
227 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  65.64 
 
 
231 aa  293  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  63.44 
 
 
225 aa  291  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  65.44 
 
 
229 aa  289  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  63 
 
 
225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  64.16 
 
 
230 aa  284  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  61.75 
 
 
228 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  60.53 
 
 
233 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.77 
 
 
224 aa  268  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  62.62 
 
 
229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  64.82 
 
 
225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  61.11 
 
 
225 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  62.88 
 
 
227 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  61.95 
 
 
263 aa  258  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  61.4 
 
 
259 aa  252  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
238 aa  248  5e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  61.5 
 
 
234 aa  247  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  58.1 
 
 
213 aa  244  8e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.82 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 
229 aa  198  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  46.35 
 
 
232 aa  193  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  44.12 
 
 
268 aa  184  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 
232 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 
219 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  45.45 
 
 
224 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  43.12 
 
 
269 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
226 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 
222 aa  175  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
229 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  42.92 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  44.29 
 
 
222 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 
225 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 
233 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  44.93 
 
 
218 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 
229 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  44.55 
 
 
241 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  45.15 
 
 
221 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  41.74 
 
 
245 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  45.15 
 
 
221 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  42.99 
 
 
225 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  42.27 
 
 
226 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  40.36 
 
 
225 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  45.15 
 
 
221 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  41.44 
 
 
221 aa  168  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  42.27 
 
 
233 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  40.36 
 
 
225 aa  168  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  44.17 
 
 
219 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  41.82 
 
 
232 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  44.17 
 
 
219 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  44.66 
 
 
221 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  40.36 
 
 
225 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  43.58 
 
 
224 aa  166  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  44.04 
 
 
230 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  40.36 
 
 
225 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  42.34 
 
 
231 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  40.99 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  40.99 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  47.09 
 
 
228 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  41.63 
 
 
235 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  44.67 
 
 
221 aa  165  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  43.69 
 
 
218 aa  165  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  47.95 
 
 
225 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  45.77 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  44.67 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  40.99 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  43.9 
 
 
229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  38.01 
 
 
231 aa  164  9e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  40.99 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  40.62 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  40.99 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  47.95 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  41.82 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  42.29 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  40.91 
 
 
247 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  41.82 
 
 
231 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  38.64 
 
 
229 aa  162  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  37.56 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  44.16 
 
 
226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  40.82 
 
 
223 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  43.12 
 
 
230 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  45.24 
 
 
228 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  48.5 
 
 
223 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>