More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0086 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  100 
 
 		 522 aa  1036    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  58.4 
 
 		 494 aa  531  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  53.3 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  43.9 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  48.49 
 
 		 500 aa  349  9e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  41.5 
 
 		 446 aa  336  5.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  40.49 
 
 		 453 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  43.94 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  34.28 
 
 		 445 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  36.79 
 
 		 453 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  35.35 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  32.04 
 
 		 448 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  31 
 
 		 443 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  34.91 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 446 aa  202  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  30.47 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 448 aa  187  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 442 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  29.36 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.14 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.14 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.14 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.14 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.14 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.92 
 
 		 469 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.27 
 
 		 492 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  30.75 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  26.87 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  31.13 
 
 		 449 aa  128  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 503 aa  127  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 472 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 524 aa  121  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  23.97 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.48 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  27.75 
 
 		 503 aa  120  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  33.03 
 
 		 238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.03 
 
 		 482 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  28.57 
 
 		 458 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  24.75 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 463 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  31.09 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 438 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 525 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  24.93 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 448 aa  99.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 485 aa  99.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 455 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 461 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.3 
 
 		 454 aa  98.6  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 454 aa  97.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 499 aa  97.1  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 505 aa  96.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 462 aa  97.1  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 538 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  30.13 
 
 		 494 aa  94.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.83 
 
 		 472 aa  94.7  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 500 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 490 aa  93.6  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 454 aa  93.6  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.26 
 
 		 463 aa  93.2  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  22.83 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 457 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  21.41 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>