97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0084 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0084  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
367 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.650398 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09490  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.03 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.457964  normal  0.625524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1590  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1581  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3177  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0851  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 
374 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32 
 
 
411 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  34.09 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  37.12 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  31.2 
 
 
398 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.54 
 
 
410 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  31.2 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  31.2 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  32.58 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.8 
 
 
437 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  34.52 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  31.82 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  31.33 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  33.12 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21590  Predicted permease  29.66 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  30.4 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  32.76 
 
 
391 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0899  protein of unknown function DUF214  35.12 
 
 
415 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  30.71 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  32.54 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  30.71 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  30.71 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  30.71 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  38.79 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  28.29 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  30.71 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  30.71 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  34.33 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  30 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  34.33 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  36.21 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  32.74 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.31 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.46 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.33 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  33.1 
 
 
423 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 
420 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 
400 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  31.45 
 
 
394 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  39.34 
 
 
420 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 
420 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.91 
 
 
849 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  25.24 
 
 
399 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32 
 
 
882 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  25.12 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  31.03 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  25.12 
 
 
399 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3803  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  34.75 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  35.04 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  29.27 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.85 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  29.47 
 
 
402 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.85 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.85 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  25.12 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.08 
 
 
405 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  25.62 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  33.06 
 
 
656 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  35.19 
 
 
827 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  33.33 
 
 
657 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  30.17 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 
405 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 
405 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  35.9 
 
 
456 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  35.65 
 
 
666 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  31.58 
 
 
414 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  30.43 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  37.39 
 
 
816 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  35.09 
 
 
656 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  26.72 
 
 
885 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  29.03 
 
 
1090 aa  42.7  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  24.27 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  24.14 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
416 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  24.27 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 
409 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  24.27 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  24.27 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.707712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>