More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0069 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0069  ribosomal protein S14  100 
 
 		 100 aa  196  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.590343  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1466  ribosomal protein S14  64.42 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36480  SSU ribosomal protein S14P  57.43 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.833214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0605  ribosomal protein S14  59 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0161  ribosomal protein S14  59.8 
 
 		 101 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3721  30S ribosomal protein S14  58.42 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3919  30S ribosomal protein S14  57.43 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19170  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.205421  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12093  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000485433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0285  ribosomal protein S14  56.73 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.28128  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2905  30S ribosomal protein S14  56.44 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378522  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5491  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 		 101 aa  104  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  0.0421593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2853  30S ribosomal protein S14  55.45 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544731  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1310  30S ribosomal protein S14  53.47 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3373  30S ribosomal protein S14  52.48 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3293  ribosomal protein S14  55.45 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3982  ribosomal protein S14  51 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1754  30S ribosomal protein S14  46 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00383016  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1360  30S ribosomal protein S14  47 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00133501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2822  ribosomal protein S14  47 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00224384 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1077  30S ribosomal protein S14  48 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3511  ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000387623  hitchhiker  0.0000000964765 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1272  ribosomal protein S14  50 
 
 		 95 aa  93.2  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0604  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0439  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000050629  hitchhiker  0.0000949985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0614  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1969  30S ribosomal protein S14  49.5 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000314461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3006  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239301  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3311  30S ribosomal protein S14  45 
 
 		 100 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00951  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288651  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0502  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000100367  hitchhiker  0.00403438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0497  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000674394  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5774  ribosomal protein S14  48 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0491474  normal  0.403708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4356  ribosomal protein S14  48 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629115  normal  0.0416375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2937  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000210491  hitchhiker  0.000000785932 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0446  30S ribosomal protein S14  44 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05785  ribosomal protein S14  46 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3270  30S ribosomal protein S14  44 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3284  30S ribosomal protein S14  48.51 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000159441  hitchhiker  0.00000214685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0855  ribosomal protein S14  48 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3325  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000022678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0732  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0027936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0340  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3936  30S ribosomal protein S14  48.08 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00743  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3746  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000320065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1921  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  87  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1220  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2311  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170574  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1183  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.552598  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4043  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000318217  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0332  SSU ribosomal protein S14P  47.06 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.84975e-18  unclonable  0.0000000474236 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2161  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000755584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0213  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000765112  unclonable  0.00000853869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1613  30S ribosomal protein S14  46 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0308  ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000208826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001729  SSU ribosomal protein S14p (S29e)  44.55 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000996787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1588  30S ribosomal protein S14  46 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3304  30S ribosomal protein S14  46.15 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00814384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0212  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000559885  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0207  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000156094  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0471  SSU ribosomal protein S14P  47.52 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0209  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4157  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000237704  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0212  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604107  hitchhiker  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0244  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0267  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0687464  normal  0.437866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0161  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000142165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0168  ribosomal protein S14  42 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000187537  hitchhiker  3.50786e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0066  30S ribosomal protein S14  48.08 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1628  ribosomal protein S14  44 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1424  30S ribosomal protein S14  46 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000838917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0418  30S ribosomal protein S14  47.52 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000392658  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12771  30S ribosomal protein S14  43 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.292627  normal  0.0214464 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1397  30S ribosomal protein S14  46 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000161259  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0333  30S ribosomal protein S14  43.56 
 
 		 101 aa  84.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0226  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000624437  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4304  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000890195  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0289  30S ribosomal protein S14  45.19 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000215365  normal  0.0115353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0262  30S ribosomal protein S14  45.19 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000389455  hitchhiker  0.00180816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2746  30S ribosomal protein S14  45.19 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0280  30S ribosomal protein S14  45.19 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000109456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0361  30S ribosomal protein S14  45.19 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000769371  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0340  30S ribosomal protein S14  45.19 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00119907  normal  0.0120704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0213  ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2312  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00369177  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0809  30S ribosomal protein S14  44 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.815003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3460  30S ribosomal protein S14  45.19 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000254777  decreased coverage  0.00448614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0183  30S ribosomal protein S14  46.53 
 
 		 101 aa  84.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000146955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0171  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  decreased coverage  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0298  30S ribosomal protein S14  44.55 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13911  30S ribosomal protein S14  43 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3149  SSU ribosomal protein S14P  44 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.457334  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2188  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.913907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2466  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0384  30S ribosomal protein S14  46 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0184  30S ribosomal protein S14  47 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2205  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0063  30S ribosomal protein S14  47.12 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147602  hitchhiker  8.43834e-17 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2151  30S ribosomal protein S14  45.54 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>