221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0067 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0067  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  100 
 
 
90 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.933007  normal  0.510342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28580  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  57.3 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00406387  normal  0.0448712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4853  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  58.62 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4007  HPr family phosphocarrier protein  54.35 
 
 
92 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4227  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50.56 
 
 
89 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07040  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  48.89 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0079  phosphotransferase system, HPr  56.32 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0088  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.32 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0355073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0069  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.32 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0753  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.65 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3185  HPr family phosphocarrier protein  58.14 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0997198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0093  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2174  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339455  hitchhiker  0.00100115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1050  phosphocarrier, HPr family  47.13 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0187  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.02 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2216  phosphocarrier, HPr family  57.47 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.081711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0298  HPr family phosphocarrier protein  43.48 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15370  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  51.72 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363386  normal  0.66532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1539  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00351141  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03520  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  58.06 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.58475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1889  HPr family phosphocarrier protein  43.18 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0357203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0524  phosphocarrier, HPr family  45.16 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1269  phosphocarrier, HPr family  41.46 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.034972 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  37.65 
 
 
88 aa  60.8  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1325  phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000175669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2487  phosphoryl transfer system, HPr  42.17 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.685989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8115  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.53 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4027  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  36.78 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0620705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2146  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.14 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1780  phosphocarrier protein HPr  37.5 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0365608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1429  phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase  41.98 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4116  phosphocarrier protein HPr  36.76 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4180  phosphocarrier protein HPr  36.76 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3878  phosphocarrier protein HPr  38.24 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.050969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2748  phosphocarrier protein HPr  36.76 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0121246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3201  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  42.68 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1462  phosphocarrier, HPr family  43.68 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.46 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0643  phosphocarrier protein HPr  38.03 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.958845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  43.37 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0103  phosphocarrier protein HPr  38.03 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0536118  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16870  phosphotransferase system HPr (HPr) family protein  50 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.288242  normal  0.471923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7069  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  44.93 
 
 
691 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4547  phosphocarrier protein NPr  36.47 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3959  phosphocarrier protein HPr  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.130103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3790  phosphocarrier protein HPr  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.190201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3805  phosphocarrier protein HPr  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4268  phosphocarrier protein HPr  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4158  phosphocarrier protein HPr  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00355795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4069  phosphocarrier protein HPr  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.486642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1080  phosphocarrier protein HPr  35.29 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0882  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.15 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000535519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2214  HPr family phosphocarrier protein  43.94 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5261  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.29 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0876  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.71 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.45631  normal  0.298141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5267  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.96 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0913  phosphocarrier protein HPr  33.82 
 
 
91 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2118  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.03 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1243  phosphocarrier protein HPr  38.24 
 
 
87 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.691712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1294  phosphocarrier protein HPr  35.21 
 
 
88 aa  50.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000628889  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  33.71 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  33.72 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1156  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  43.66 
 
 
237 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0444  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  38.75 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.23 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4845  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.06 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.778236  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0821  phosphocarrier protein HPr  38.46 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4827  phosphocarrier, HPr family  36.59 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.16 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4151  phosphocarrier HPr protein  27.59 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  30.23 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1091  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  35.71 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3771  HPr family phosphocarrier protein  40 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03197  phosphocarrier protein NPR  40 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.789521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4457  phosphocarrier protein HPr  29.89 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.576235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  27.59 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0015  HPrNtr  31.91 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2230  HPrNtr  32.97 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1549  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  39.13 
 
 
86 aa  47.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000108973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2256  HPr family phosphocarrier protein  35.21 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.99583  normal  0.188388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0331  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  27.91 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0987  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2737  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  34.09 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0535175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1951  phosphoryl transfer system HPr  39.13 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000513673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57980  putative phosphoryl carrier protein  29.27 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2030  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  39.56 
 
 
836 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1765  HPr family phosphocarrier protein  35.21 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.730947  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1843  HPr family phosphocarrier protein  35.21 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2036  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.14 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.67189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1995  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.39 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0948  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
90 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1641  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  26.74 
 
 
88 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0955  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.03 
 
 
90 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38141  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2138  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  32.94 
 
 
87 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.580759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6112  dihydroxyacetone kinase, phosphotransfer subunit  41.67 
 
 
246 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.334192  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1641  phosphocarrier protein (Hpr)  35.62 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3381  phosphocarrier, HPr family protein  36.9 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.497363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1528  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  36.92 
 
 
703 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  31.11 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.660983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>