More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0047 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 386 aa  795    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  71.81 
 
 		 381 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  49.62 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 		 444 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  49.33 
 
 		 389 aa  349  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  47.03 
 
 		 372 aa  345  7e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  45.12 
 
 		 372 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  46.47 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  45.95 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  48.38 
 
 		 367 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  47.14 
 
 		 364 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  40.96 
 
 		 377 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  43.35 
 
 		 375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  40.43 
 
 		 378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  40.43 
 
 		 377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  40.43 
 
 		 377 aa  319  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  42.55 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  45.03 
 
 		 376 aa  308  6.999999999999999e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  44.2 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  41.47 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  39.95 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  39.36 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  44.01 
 
 		 375 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  39.53 
 
 		 342 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  37.06 
 
 		 349 aa  279  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  38.67 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.27 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  37.36 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  37.78 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  35.25 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  37.3 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  36.59 
 
 		 561 aa  231  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  35.18 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  33.97 
 
 		 356 aa  223  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 		 356 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  35.52 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 		 358 aa  212  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  35.08 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.78 
 
 		 325 aa  201  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  33.24 
 
 		 769 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.22 
 
 		 479 aa  195  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  34.44 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.79 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.7 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  33.98 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 		 496 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32.81 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  31.77 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  31.59 
 
 		 333 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 332 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.17 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.75 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.23 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.27 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.83 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  34.51 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 380 aa  142  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.6 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 415 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.54 
 
 		 390 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>