102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0028 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0028  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
344 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.038323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
355 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1311  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
353 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1328  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
353 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1347  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
353 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.407734  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05199  glycosyltransferase  26.74 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3269  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001318  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsI glycosyltransferase  27.95 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18845  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2905  hypothetical protein  35.91 
 
 
289 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
365 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  28.23 
 
 
381 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  28.14 
 
 
360 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.62 
 
 
387 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.7 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  22.54 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  25.68 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  24.84 
 
 
419 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4919  group 1 glycosyl transferase  27.33 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.568144  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
383 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
357 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  28.51 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.41 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.32 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
401 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
396 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
381 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
400 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
376 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
704 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  20.76 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
388 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  23.59 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
379 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0811  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
361 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4097  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.627291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  23.17 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.18 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  21.86 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0741  glycosyltransferase-like protein  27.4 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1727  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
389 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00570551  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
412 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
357 aa  46.6  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
407 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  22.6 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
436 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
412 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  22.82 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
390 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  27.03 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
439 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 
435 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  22.31 
 
 
408 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3874  putative glycosyltransferase  21.61 
 
 
361 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59519  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
381 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
398 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
371 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
392 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.3 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
377 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
390 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
418 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
387 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>