278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4036 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  63.85 
 
 		 131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  61.48 
 
 		 135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  62.96 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  56.82 
 
 		 165 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  57.48 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  57.48 
 
 		 140 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  48.46 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  48.18 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  43.61 
 
 		 137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  46.15 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  44.03 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  44.78 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  41.79 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  45.59 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  44.85 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  44.62 
 
 		 155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  42.34 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  42.96 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  44.44 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  52.21 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  40.3 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  41.09 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  44.35 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  40.44 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  41.43 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  44.09 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  43.55 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  41.67 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  41.09 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  40.46 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  44.92 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  39.69 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  39.69 
 
 		 197 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  36.92 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  36.13 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  42.28 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  40.6 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  38.28 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1744  ribosome-binding factor A  39.02 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  38.05 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0319  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  38.78 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  32.67 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  36.43 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  34.31 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0370  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  32.32 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  32 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  39.47 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  33.83 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  33 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2707  ribosome-binding factor A  32.31 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.150572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  28.46 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  34.69 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  28.93 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  34.04 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0286  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 184 aa  57  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  34.65 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  33.67 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  37.37 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  30.95 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  30.1 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  32.82 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2416  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  39 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  32.58 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  34.65 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3033  ribosome-binding factor A  34.68 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000370905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  34.38 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  32.99 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  32.99 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0493  ribosome-binding factor A  34.31 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.852229  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0564  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  34.69 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>