89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3944 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3944  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 422 aa  851    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.282645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  37.26 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1699  extracellular solute-binding protein family 1  37.35 
 
 		 419 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5076  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340965  normal  0.383073 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5356  extracellular solute-binding protein family 1  32.45 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0798754  normal  0.176605 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5755  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  31.88 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0711  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3526  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.077506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3675  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0659  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 435 aa  140  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3075  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0067  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  29.64 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.33 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.36 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1679  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000895921  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25.38 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  20.73 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.07 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.16 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.05 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.5 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  20.06 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.36 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.52 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  20.38 
 
 		 366 aa  50.8  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 445 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.23 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.55 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.82 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 445 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 458 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 434 aa  46.6  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.33 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  21.79 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1686  extracellular solute-binding protein family 1  20.75 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4516  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.54 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.63 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 504 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  20.64 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 484 aa  43.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>