32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3852 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3852  FixH  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0666  nitrogen fixation protein fixH  43.59 
 
 
155 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2539  FixH  44.16 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1843  FixH family protein  47.92 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315454  normal  0.750998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0691  RdxH  42.21 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.428147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2346  FixH family protein  42.21 
 
 
152 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0539  FixH family protein  42.86 
 
 
152 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0358  FixH protein, putative  33.76 
 
 
165 aa  87.8  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.255375  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0374  putative FixH protein  33.76 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0464  FixH family protein  32.91 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.702406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  33.11 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1154  FixH family protein  37.78 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0322721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2573  integral membrane protein linked to a cation pump-like  34.01 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2442  FixH family protein  36.62 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.504477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  36.3 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  32.89 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1671  integral membrane protein linked to a cation pump-like protein  31.82 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.899771  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5930  FixH family protein  29.33 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  31.58 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  33.57 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  34.48 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4957  FixH family protein  29.77 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144281  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  33.56 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  34.38 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2391  nitrogen fixation protein FixH  29.37 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0333218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  30.87 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  30.87 
 
 
166 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  29.37 
 
 
166 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5021  FixH family protein  28.15 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0087  hypothetical protein  30 
 
 
168 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.01404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1223  hypothetical protein  36.36 
 
 
283 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.808212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  23.68 
 
 
186 aa  40.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>