More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3824 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3824  carnitinyl-CoA dehydratase  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2177  carnitinyl-CoA dehydratase  78.21 
 
 
260 aa  397  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2793  carnitinyl-CoA dehydratase  78.93 
 
 
262 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4496  carnitinyl-CoA dehydratase  77.91 
 
 
260 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6427  carnitinyl-CoA dehydratase  78.21 
 
 
260 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0773565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  54.47 
 
 
261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  54.47 
 
 
297 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.47 
 
 
261 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  54.47 
 
 
297 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  54.09 
 
 
297 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  54.47 
 
 
261 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  54.47 
 
 
261 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  53.31 
 
 
261 aa  280  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  54.09 
 
 
261 aa  279  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  54.09 
 
 
261 aa  278  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  53.7 
 
 
261 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  53.7 
 
 
261 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  53.7 
 
 
261 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  52.92 
 
 
261 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  53.31 
 
 
261 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  53.31 
 
 
261 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
264 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.17 
 
 
265 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2640  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
257 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  44.88 
 
 
257 aa  178  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
268 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 
265 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.37 
 
 
265 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
261 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  39.93 
 
 
266 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  39.69 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
259 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
249 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
249 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
249 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.64 
 
 
266 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5216  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 
266 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.281677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.83 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
797 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1818  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
247 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
249 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1771  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
247 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1752  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
247 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1990  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
253 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
267 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
254 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1675  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
259 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4093  short chain enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
266 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4716  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
269 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530028  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4628  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
269 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  38 
 
 
257 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6741  short chain enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
255 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 
265 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5010  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625165  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
273 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
263 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
261 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3503  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 
257 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
257 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1667  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
254 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
260 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  34.88 
 
 
256 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
287 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
268 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0998  crotonobetainyl-CoA hydratase  40.16 
 
 
254 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 
269 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
258 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
271 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
262 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
262 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  35.93 
 
 
266 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5154  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.53 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295779  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2232  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1280  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
260 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0590301  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3309  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
273 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 
254 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
259 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
254 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  40.87 
 
 
263 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
257 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
256 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
285 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134607  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
262 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
262 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>