92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3780 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3780  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 175 aa  334  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.642043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0961  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  28.32 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.093725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0710  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  41.23 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0086052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1506  triosephosphate isomerase (TIM; Triose-phosphateisomerase)  26.59 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1622  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  33.33 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1735  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.59 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0099  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  35.59 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0669056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3149  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.24 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0190342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28441  TRAP-T family tripartite transporter  36.07 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.922538 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1781  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.07 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000929504 
 
 
-
 
NC_004310  BR0343  hypothetical protein  31.62 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0359  hypothetical protein  31.62 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.537959  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2293  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.71 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0444  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.62 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0130  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  26.42 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2871  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.3 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1403  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  26.95 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1553  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  34.78 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1574  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  32.48 
 
 		 198 aa  62  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0672  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.83 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2833  hypothetical protein  34.56 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0392  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  38.61 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000784844  hitchhiker  0.00380366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1504  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.17 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4834  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.08 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0357026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3751  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.38 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.602482 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1415  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.58 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2649  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  34.55 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1711  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.62 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0725939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1688  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.9 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3478  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.5 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1205  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.73 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0831  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  34.55 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0694  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.92 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1814  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.93 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1218  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  32.46 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1970  TRAP dicarboxylate transporter  30.13 
 
 		 688 aa  58.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413092  normal  0.415684 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0654  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.09 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.197985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2812  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.58 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0601  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.58 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2881  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.14 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.901818  hitchhiker  0.000150044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2752  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.13 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.328918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0885  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.81 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000127189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3061  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287187  hitchhiker  0.000081525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1476  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.25 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661481  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0190  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.86 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3396  TRAP transporter - DctQ subunit  25.84 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1753  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.08 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.167958  normal  0.437014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3474  putative TRAP C4-dicarboxylate transport system, DctQ subunit (small permease component)  28.57 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3372  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  32.46 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0364  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.04 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0893  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000529967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4765  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0417  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.25 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000370406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0959  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.82 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1202  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.85 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00964001  normal  0.857795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4360  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.91 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0426  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.63 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.196909  normal  0.0233396 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2006  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  37.65 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.404305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1041  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.82 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0743648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5133  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  35.21 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4424  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.99 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3674  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.58 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.396791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2246  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.61 
 
 		 202 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.417251  normal  0.0283707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2019  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.86 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126943  normal  0.0153183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2544  TRAP-type transport system, small permease component  42.53 
 
 		 168 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2190  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.27 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0453  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.46 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0983838  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0122  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.07 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3030  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.05 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3000  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.76 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3119  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.76 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000112797  normal  0.654316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1565  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.2 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.124017  normal  0.0201638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2882  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3652  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.96 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0471948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3769  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1556  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.79 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0086  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.44 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3390  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.35 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003133  TRAP dicarboxylate transporter DctQ subunit  33.33 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00512706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2601  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  35.65 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3621  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.53 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.767464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1612  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  39.51 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2072  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.22 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2051  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.79 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2150  TRAP transporter, small subunit  30.43 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2658  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.62 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3640  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.6832  normal  0.687836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0086  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  37.14 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1561  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.73 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.497351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1148  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.58 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1940  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.22 
 
 		 222 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1265  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  24.27 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>