More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3767 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  100 
 
 		 289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  73.55 
 
 		 292 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  66.9 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  62.24 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  60.28 
 
 		 287 aa  354  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  59.72 
 
 		 287 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  59.15 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44.36 
 
 		 289 aa  248  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  46.1 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  46.92 
 
 		 304 aa  238  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  45.25 
 
 		 287 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  44.87 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  44.87 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  44.87 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  45.35 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  47.22 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  45.11 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  44.44 
 
 		 312 aa  223  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  44.44 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  43.97 
 
 		 295 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  38.68 
 
 		 288 aa  222  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  41.49 
 
 		 287 aa  221  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  44.74 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  43.4 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  48.25 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  44.35 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  44.53 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.22 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  44 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  43.77 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  46.21 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  49.33 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  44.14 
 
 		 301 aa  211  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  39.86 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  39.47 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  43.87 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  41.13 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  46.05 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  46.05 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  43.48 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  43.48 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  43.48 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.48 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.48 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  43.75 
 
 		 295 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.08 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  43.08 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  43.08 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.48 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.48 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  41.03 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  43.08 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  38.32 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  41.92 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  41.54 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  41.15 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  44.66 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  39.55 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  38.85 
 
 		 292 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  39.53 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  41.54 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  38.98 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  37.98 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  36.55 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  36.55 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3510  methylisocitrate lyase  42.86 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.120815  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  39.15 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  38.26 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  41.6 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  39 
 
 		 292 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2287  methylisocitrate lyase  41.6 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.298126  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  39.11 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  36.21 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  36.21 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  36.21 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  39.85 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  37.69 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  37.12 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  39.34 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  39.34 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  39.11 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  38.52 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  39.85 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  37.69 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  39.34 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  40.15 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  40.23 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  40.23 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  41.22 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  39.45 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  41.22 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4356  2-methylisocitrate lyase  40.08 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  41.22 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  37.31 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  38.97 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  41.84 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  40.23 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  38.46 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0462  2-methylisocitrate lyase  39.7 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237337  hitchhiker  0.00000000745318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  36.86 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>