More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3556 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  726    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  52.05 
 
 
378 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  55.68 
 
 
355 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  57.42 
 
 
362 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03907  fused maltose transport subunit, ATP-binding component of ABC superfamily/regulatory protein  53.53 
 
 
371 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3960  ABC transporter related protein  53.53 
 
 
371 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5516  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 
371 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.301255  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3994  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 
371 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.153747  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4497  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 
371 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.64 
 
 
369 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.63 
 
 
365 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4587  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 
371 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.64 
 
 
369 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.64 
 
 
369 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  57.32 
 
 
366 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.64 
 
 
369 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03867  hypothetical protein  53.53 
 
 
371 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4275  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.53 
 
 
371 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.64 
 
 
369 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  57.23 
 
 
368 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  54.32 
 
 
362 aa  364  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  57.23 
 
 
368 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  55.68 
 
 
354 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  53.33 
 
 
366 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
359 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  52.89 
 
 
391 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  56.02 
 
 
362 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  53.3 
 
 
359 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  55.46 
 
 
362 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.55 
 
 
369 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  51.1 
 
 
379 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  53.59 
 
 
366 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  55.1 
 
 
362 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  54.11 
 
 
333 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  56.3 
 
 
366 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  54.44 
 
 
375 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  52.6 
 
 
353 aa  359  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  53.31 
 
 
366 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  53.22 
 
 
361 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  49.86 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  53.85 
 
 
370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  54.47 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.34 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  52.15 
 
 
385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  52.37 
 
 
363 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.01 
 
 
369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.07 
 
 
351 aa  355  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 
373 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  52.62 
 
 
361 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  52.49 
 
 
360 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.14 
 
 
332 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 
369 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  49.73 
 
 
371 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  53.71 
 
 
363 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 
369 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.46 
 
 
369 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  51.5 
 
 
367 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6023  ABC transporter related  53.66 
 
 
384 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.963161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  55.65 
 
 
353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  54.55 
 
 
354 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  54.23 
 
 
357 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  57.28 
 
 
369 aa  352  8e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  52.1 
 
 
366 aa  352  8e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  53.52 
 
 
359 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  52.99 
 
 
363 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  50.97 
 
 
360 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  55.56 
 
 
325 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  53.89 
 
 
352 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  49.72 
 
 
371 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  52.97 
 
 
360 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  52.82 
 
 
360 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  55.8 
 
 
360 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  55.9 
 
 
374 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.3 
 
 
352 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  54.52 
 
 
325 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  52.56 
 
 
338 aa  349  5e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  52.33 
 
 
350 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  53.01 
 
 
352 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  53.3 
 
 
355 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.42 
 
 
381 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  53.65 
 
 
359 aa  348  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  51.64 
 
 
380 aa  348  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  51.79 
 
 
364 aa  348  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  55.07 
 
 
353 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  50.86 
 
 
354 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  52.68 
 
 
358 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6323  ABC transporter related  52.84 
 
 
384 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  51.97 
 
 
349 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.3 
 
 
354 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  53.11 
 
 
357 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  51.53 
 
 
365 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  54.34 
 
 
354 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  51.37 
 
 
376 aa  347  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  51.83 
 
 
345 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  57.37 
 
 
358 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  52.78 
 
 
380 aa  346  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  53.69 
 
 
333 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  53.99 
 
 
354 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>