177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3543 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  520  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  59.68 
 
 		 281 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  55.69 
 
 		 266 aa  268  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  55.56 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  54.47 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  50.2 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  42.68 
 
 		 237 aa  174  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  38.56 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  35.81 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  33.6 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 		 505 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  29.67 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  27.1 
 
 		 439 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  30.33 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  25.7 
 
 		 443 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  25.41 
 
 		 437 aa  89  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  28.51 
 
 		 321 aa  88.6  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  28.85 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 		 287 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  25.7 
 
 		 439 aa  85.9  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  25.7 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  24.11 
 
 		 447 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  29.34 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  31.35 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  29.34 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 		 279 aa  72  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  30.27 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  25.73 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  31.22 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  28.04 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  29.74 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  31.51 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.49 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  29.84 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  24.71 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  29.79 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0273  Prephenate dehydrogenase  27.19 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.974204  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  26.09 
 
 		 288 aa  62  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.27 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.29 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.27 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  32.64 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  25.81 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.54 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  30 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  30 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0183  prephenate dehydrogenase  27.5 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.82 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0205  Prephenate dehydrogenase  27.5 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.1 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.23 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43288  prephenate dehydrogenase  21.17 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.57 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.23 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  26.18 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  25.32 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  31.47 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.17 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  25.51 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  41.67 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  25.68 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.98 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  27.98 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0194  Prephenate dehydrogenase  26.5 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0203  prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.503225  hitchhiker  0.00431893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  26.29 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.37 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 		 292 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.33 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  24.31 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.84 
 
 		 311 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  26.53 
 
 		 293 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.84 
 
 		 311 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  26.9 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  25.97 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 		 390 aa  52.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2572  prephenate dehydrogenase  26.47 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  26.62 
 
 		 288 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  29.15 
 
 		 370 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  28.28 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  28.06 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.58 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>