More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3511 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3511  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  554  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.00000000292695  hitchhiker  0.000232914 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3717  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0598808 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 261 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1169  IclR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 275 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.68 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 253 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  25.34 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.13 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.55 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 546 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.48 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.89 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.89 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  24.36 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  28.94 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.89 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  29.82 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.21 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  27.9 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 544 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  28.74 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  25.31 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  29.37 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  25.93 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  25.7 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.48 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6477  regulatory protein, IclR  26.67 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.32 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  25.3 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  26.4 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  25.45 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.44 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  26.51 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  24.3 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  23.48 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>