23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3441 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1259    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  36.77 
 
 		 553 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  35.13 
 
 		 566 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  34.97 
 
 		 566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  32.52 
 
 		 582 aa  276  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  29.62 
 
 		 563 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  23.37 
 
 		 436 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  24.4 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  24.63 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  24.51 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  25.36 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  40.51 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  22.96 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  35.44 
 
 		 419 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  25.25 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  23.9 
 
 		 483 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2499  hypothetical protein  25.12 
 
 		 631 aa  50.8  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.33724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  28.47 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  25.36 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  24.64 
 
 		 666 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  28.5 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  26.09 
 
 		 443 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  44.3  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>